Valeur absolue d'identité entre protéines

[Aqualung]

Bonjour à tous,

J'ai une questions au sujet de la comparaison de séquence entre deux protéines.

Existe-t-il une valeur absolue minimale d'identité à partir de laquelle on peut se dire si deux protéines partagent une homologie? J'ai blasté deux protéines. Sur la région concernée elles possèdent 40% d'identité mais, sur la région complète des deux séquences, seulement 15%...Mes protéines sont-elles homologues?

Merci d'avance de votre réponse
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[Edelweiss68]

Bonsoir,

"Si deux séquences de 100 résidus ou plus présentent plus de 25% d'identité alors elles sont probablement homologues.

Si elles présentent moins de 25 % d'identité (Twilight Zone) on ne peut pas conclure quand à leur homologie (Doolittle, 1990)."

http://www.u-bordeaux1.fr/exobio07/f...s/Lespinet.pdf

"30 % de similarité entre deux protéines sur plus de 100 acides-aminés ⇒ homologie."

http://lbbma.univ-angers.fr/educatio...ilsBioinfo.pdf

[Aqualung]

Parfait merci beaucoup

[Edelweiss68]

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