méthode RFLP

[invite3a8ed84a]

Bonjour,
je ne comprends pas comment l'on choisit les sondes lors de la méthode RFLP? quelqu'un pourrait m'éxpliquer?
Merci
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[invite02e16773]

On choisit des sondes qui vont révéler différemment l'ADN cible selon qu'on a clivage ou absence de clivage.

Le plus simple est donc de prendre une sonde dont la séquence contient le site de restriction de l'enzyme.
Ainsi, en cas de coupure (allèle 1 du RFLP) => 2 signaux. En cas d'absence de coupure (allèle 2 du RFLP) => 1 signal, plus intense.

Mais on pourrait aussi imaginer 2 sondes se fixant de part et d'autre du site de coupure.
En cas de non coupure, on aurait un signal intense de haut poids moléculaire.
Et en cas de coupure, deux signaux moins intense de plus faible poids moléculaire.

Et il faut répéter ceci pour chaque marqueur RFLP analysé. Donc définitivement la solution 1 est celle qui est adoptée (à ma connaissance).