Analyse de cluster !!

[invite4ae3ed6a]

Bonjour,
j'ai un article à analyser, il s'agit du: hight resolution anatomical atlas of the transcriptome in the mouse embryo..
Je cale en fait sur l'analyse du cluster, je comprends pas exactement pourquoi on fait des permutations dans un cluster de gènes avant de l'annoter (c'est dit dans l'article que c'est pour enrichir l'annotation)?!!
aussi, ils ont fait 4 types d'annotations:
- Gene ontology terms
- InterPro conserved domains identifiers.
- Mamalian Phenotype Ontology terms.
- Cytogenetic band.

Ils veulent dire quoi par ces ''terms'' ?
Aidez moi svp ,si quelqu'un d'entre vous a déjà travailler sur ça !!!
Merci
Amicalement
cysto
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[invitef940923e]

Bonjour pour les termes les GO (genes ontology) ce sont des classement de gènes par "fonctions" exemple : GO:0007010 : organisation du cytosquelette. Si tu va voir le GO:0007010 tu va avoir une liste de gènes impliqués dans ce processus. Interpro c'est la classification des régions "domaines" exemple : prot kinase. Mam Phen Ontology = dans quel phenotype il est impliqué et Cytogenic bande c'est les bandes du chromosomes ou est localisé le gène exemple chromosome 4 bande 3.

[invite4ae3ed6a]

Merci beaucoup pour ta réponse ...j'ai pas bien saisi l'interpro et le M.P.O ( la 2 et 3) peux tu me reformuler stp !!!
Sinon les 2 autres sont clairs merci bien !