séquençage de l'adn

[invitee8643186]

Bonjour

Je suis en pleine révisions pour les partiels et je ne comprends pas trop la différence entre une extrémité franche et une extrémité cohésives après qu'une endonucléase ait coupé l'adn ... est ce que quelqu'un aurait une explication s'il vous plait ?
-----

[invite326288e4]

un exemple est mieux que tout :

EcoRI : coupe le motif 5'GAATTC3' et engendre des extrémités cohésives
5'---G AATTC---3'
3'---CTTAA G---5'
=> une extrémité sortante en 5' (AATTC) et une rentrante en 3' (G)

SmaI : coupe le motif 5'CCCGGG3' et engendre des extrémités franches
5'---CCC GGG---3'
3'---GGG CCC---5'
=> extrémités franches / "bords nets"

sources : wikipedia (avec d'autres exemples ^^)

[invitee8643186]

d'accord, merci. Mais la différence ça voudrait dire que lorsque l'on obtient une extrémité cohésive, une polymérase peut compléter le "trou" (je ne sais pas comment on appelle ça) ? tandis que lorsque l'on a une extrémité franche une polymérase peut rien faire ?

[Flyingbike]

c'est l'inverse. Avec une extrémité cohésive, il y a un brin qui dépasse. Une polymérase peut compléter le brin le plus court en utilisant le plus long comme matrice. Sur une extrémité franche, une polymérase ne peut rien faire.

[A voir en vidéo sur Futura]