Répondre à la discussion
Affichage des résultats 1 à 6 sur 6

Retrouver la séquence ARNm d'une protéine



  1. #1
    AstroBax

    Retrouver la séquence ARNm d'une protéine


    ------

    Bonjour à tous,

    J'ai aujourd'hui du chercher la séquence ARNm (épissée) d'une protéine. Après un peu de recherche, j'ai fini par trouvé, en passant par NCBI, puis en retrouvant la CCDS. Est-ce que quelqu'un aurait une autre technique, ou bien un outils plus performant/rapide?

    Merci.

    Astro

    -----
    La science ne sert guère qu'à nous donner une idée de l'étendue de notre ignorance.

  2. Publicité
  3. #2
    Yoyo

    Re : Retrouver la séquence ARNm d'une protéine

    Salut

    C'etait dans quel cas? Si la sequence n'est pas trop grande, tu peux convertir les acides aminés en codon (dégénérés). Il restera certaines incertitudes, mais tu auras une sequence quasi parfaite.

    YOyo

  4. #3
    AstroBax

    Re : Retrouver la séquence ARNm d'une protéine

    C'était pour connaitre le pourcentage d'uracile dans mon ARNm, du coup, non, la dégénérescence, c'est pas génial.

    Et en plus c'était une protéine de plus de 500 aa...
    La science ne sert guère qu'à nous donner une idée de l'étendue de notre ignorance.

  5. #4
    montreux_d

    Re : Retrouver la séquence ARNm d'une protéine

    Tu peux aller sur ensembl.org et trouver ainsi la séquence des exons et introns mais ce n'est pas beaucoup plus rapide!

  6. #5
    Aqualung

    Re : Retrouver la séquence ARNm d'une protéine

    Le NCBI est un bon outil, pas forcément infaillible mais un des meilleurs. Si tu travailles sur Arabidopsis il y a TAIR mais il est très lent.

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    AstroBax

    Re : Retrouver la séquence ARNm d'une protéine

    Merci à tous pour vos réponses
    La science ne sert guère qu'à nous donner une idée de l'étendue de notre ignorance.

  9. Publicité

Discussions similaires

  1. [Pré-BAC] [1èreS] Lire la séquence d'une protéine
    Par étoilenoire dans le forum Exercices en biologie
    Réponses: 15
    Dernier message: 10/01/2013, 11h04
  2. [Biochimie] Corrélation ARNm et protéine
    Par Moumoutte dans le forum Biologie
    Réponses: 7
    Dernier message: 04/11/2009, 10h21
  3. [Biologie Moléculaire] couplage inverse ARNm - protéine ??
    Par benj74 dans le forum Biologie
    Réponses: 5
    Dernier message: 06/10/2009, 17h26
  4. [Biochimie] Génétique-séquence ARNm
    Par OswaldCobblepote dans le forum Biologie
    Réponses: 4
    Dernier message: 25/06/2009, 16h52
  5. [Génétique] Traduction (ARNm --> Proteine)
    Par Cannot dans le forum Biologie
    Réponses: 0
    Dernier message: 11/11/2008, 21h32