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sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée



  1. #1
    ribotao

    sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée


    ------

    Bonjour à tous,

    Quels avantages et inconvéniants verriez-vous en tant qu'Universitaire à sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée spécialisée en génomique ?
    Mise à part une technologie de pointe que seule l'entreprise privée aurait par exemple brevetée et serait la seule à avoir (comme les puces Affymetrix), je vois pas pourquoi un Universitaire sous-traiterait son étude à une boite privée, puisqu'en générale les chercheurs préfèrent collaborer avec d'autres universitaires.

    A vous lire,


    PS: SVP afin d'éviter les réponses vagues, svp que seuls les doctorants, Post-doc ou chercheurs statutaires répondent et donnent leur avis. Merci

    -----

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  3. #2
    ratafouin

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Bonjour.

    Pour moi l'argument en faveur de l'entreprise privée va être le temps. Ces boites possèdent plusieurs machines et peuvent traiter beaucoup d'échantillons en même temps.
    Si c'est un labo qui possède la machine, vu le prix des bébés elle n'en aura qu'un, deux s'ils sont riches. Si plusieurs personnes veulent accéder au service en même temps avec la boite privée la commande seras traiter plus vite, moins d'attente qu'avec un labo universitaire.

    Quand je vois la plateforme qu'on possède dans mon campus pour ce genre de chose, les gens qui y bossent font pour la plupart parti d'équipe de recherche et ne font que du mi temps sur les plateforme d'ou encore possible perte de temps.

    Il y aurait aussi le prix à mon avis car la boite privée peut se permettre de baisser ses prix à cause de la concurrence des autres boites privées et des frais répartis sur un grand nombre de machine ce qu'un labo universitaire ne pourra pas faire.

  4. #3
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Merci beaucoup pour ta réponse! Les arguments que tu cites sont convaincants !

  5. #4
    jugen

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Bonjour à toi aussi même si j'ai envie de hurler quand je vois ton petit PS !!!!!!

    Alors je vais te répondre malgré le fait que je ne sois qu'une pauvre petite assistante ingénieur qui travaille dans une entreprise privée spécialisée en génomique et prestataire de service !

    Tout d'abord les entreprises privées qui proposent ce genre de service sont souvent CSP (Certified Service Providers) des équipements qu'elles possèdent ce qui garantit le savoir-faire des manipulateurs ainsi que la qualité des résultats. En clair tu auras accès à une "main d'œuvre" de qualité.
    Ensuite l'entreprise privée peut également s'engager sur une date de rendu des résultats ce qui n'est pas forcément le cas pour une plateforme académique qui ne donne pas priorité aux études extérieures. Ce qui se rapproche de la réponse de ratafouin.
    Enfin certaines boites privées engagent des bioinformaticiens. Ils peuvent soit designer eux-meme des puces à façon si le client le souhaite et n'a pas le temps et les connaissances requises pour le faire et peuvent également faire une analyse approfondit des résultats si nécessaire.

    Voilà ce que je peux te dire à propos de la sous-traitance de projet à une entreprise privée.
    Après à choisir entre sous-traiter donc payer (à une plateforme privée ou public) et collaborer (parce qu'il me semble que c'est ce mot que tu as utilisé) c'est peut-être tout simplement une question de temps pour la personne qui porte l'étude. Une collaboration entre universitaire peut être longue à mettre en place alors que la sous-traitance peut être très rapide. Si c'est juste une question de soutien scientifique à l'étude sache que même les entreprises privées engagent des chercheurs compétents.

    J'espère que ma réponse n'aura pas été trop vague à ton goût.

    ps : comme je l'ai dit précédemment je travaille dans une entreprise comme celle que tu décrits et des personnes comme toi avec un égaux surdimensionner on a pas trop envie de travailler avec eux !

    Sur ceux bonne journée et au revoir

  6. #5
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par jugen Voir le message
    Bonjour à toi aussi même si j'ai envie de hurler quand je vois ton petit PS !!!!!!

    Alors je vais te répondre malgré le fait que je ne sois qu'une pauvre petite assistante ingénieur qui travaille dans une entreprise privée spécialisée en génomique et prestataire de service !
    On se calme ! Par ce petit "PS" je souhaitais avoir les argumentaires de personnes directement et professionnellement en relation avec la génomique, donc je voulais poliment inviter les étudiants et autres badauds à NE PAS donner leur avis alors qu'ils n'y connaissent rien; ou éviter les réponses débiles du type : " t'as cherché dans Google ?"

    Mes plates excuses si tu t'es sentis exclus ou visé, bien aucontraire c'est des témoignages comme les tiens que je cherche !

    Donc merci de ta participation à la discussion

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Flyingbike

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Ce qui me paraît le plus avantageux dans le fait de sous-traiter de la sorte est surtout au niveau de l'analyse des résultats et de leur interprétation statistique, ce que les chercheurs ont du mal a faire d'après mes constatations.

    Je suis partisan du "se démerder soi même" mais c'est tout a fait le genre de choses que je préfèrerais déléguer, d'autant que ce genre de travail est couteux et sert souvent de base a un projet, il se doit donc d'apporter des données fiables.

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  10. #7
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par Flyingbike Voir le message
    Ce qui me paraît le plus avantageux dans le fait de sous-traiter de la sorte est surtout au niveau de l'analyse des résultats et de leur interprétation statistique, ce que les chercheurs ont du mal a faire d'après mes constatations.

    Je suis partisan du "se démerder soi même" mais c'est tout a fait le genre de choses que je préfèrerais déléguer, d'autant que ce genre de travail est couteux et sert souvent de base a un projet, il se doit donc d'apporter des données fiables.
    Je suis aussi d'accord avec toi sur le fait que les data (assez lourd) générés par la génomique (et tous les omics en générale) sont une base à un ou à des projets de recherche plus focus et plus expérimentale.

    Par conséquent, avec toutes les arguments évoqués, je suis maintenant convaincus de l'utilité de sous-traiter.

    Merci Flyingbike

  11. #8
    jugen

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par ribotao Voir le message
    On se calme ! Par ce petit "PS" je souhaitais avoir les argumentaires de personnes directement et professionnellement en relation avec la génomique, donc je voulais poliment inviter les étudiants et autres badauds à NE PAS donner leur avis alors qu'ils n'y connaissent rien; ou éviter les réponses débiles du type : " t'as cherché dans Google ?"

    Mes plates excuses si tu t'es sentis exclus ou visé, bien aucontraire c'est des témoignages comme les tiens que je cherche !

    Donc merci de ta participation à la discussion
    De rien pour la participation.
    La prochaine fois essaye de faire attention aux phrases que tu mets c'est tout. Parce que là on pourrait vraiment croire que pour toi tout avis ne venant pas d'un bac+8 n'a aucune importance ... ça fait très "je me la pète" ce qui apparemment n'est pas le cas.

    Malheureusement il existe des personnes qui pensent comme ça et on en rencontre assez souvent et ça c'est rageant

  12. #9
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par jugen Voir le message
    De rien pour la participation.
    La prochaine fois essaye de faire attention aux phrases que tu mets c'est tout. Parce que là on pourrait vraiment croire que pour toi tout avis ne venant pas d'un bac+8 n'a aucune importance ... ça fait très "je me la pète" ce qui apparemment n'est pas le cas.

    Malheureusement il existe des personnes qui pensent comme ça et on en rencontre assez souvent et ça c'est rageant
    Oui je ferais attention !
    Futura est un Forum où il y a beaucoup plus d'étudiants que de "pro" (et quelque soit leur bac+n), c'est les étudiants que je visais ... ces nazes !!!

  13. #10
    Guillaume69

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Sympa pour nous, les étudiants nazes qui n'y connaissent rien et n'ont pas d'avis à donner... Merci !

    Pour la peine, je donnerai pas mon avis.

    Il aurait pu valoir le coût pourtant, vu que je suis en stage dans un institut qui a une plateforme de génomique et une armada de bioinformaticiens, et que dans le cadre de mon projet je collabore avec eux.

    Je reviendrai dans un an, quand je commencerai ma thèse ; j'aurai pas plus d'expérience qu'aujourd'hui mais je répondrai au critère....

  14. #11
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par Guillaume69 Voir le message
    Sympa pour nous, les étudiants nazes qui n'y connaissent rien et n'ont pas d'avis à donner... Merci !

    Pour la peine, je donnerai pas mon avis.

    Il aurait pu valoir le coût pourtant, vu que je suis en stage dans un institut qui a une plateforme de génomique et une armada de bioinformaticiens, et que dans le cadre de mon projet je collabore avec eux.

    Je reviendrai dans un an, quand je commencerai ma thèse ; j'aurai pas plus d'expérience qu'aujourd'hui mais je répondrai au critère....
    On a tous été dans des instituts qui ont des plateformes de ci et de ca, moi pendant ma thèse, un de mes potes qui était assis juste à coté de moi, et avait sa paillasse à coté aussi, faisait sa thèse sur la protéomique .... mais ca fait pas de moi un expert ou un pro de protéomique pour autant ! .... si tu fais ton master recherche sur la génomique, tu réponds au critère ... cad celui de savoir de quoi tu parles en tant qu'opérationnel et/ou décideur !

  15. #12
    U.N.Owen

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Pour ma thèse je suis en train de faire des expériences de RNAseq et on a sous-traiter ça a la plateforme universitaire (pas de collaboration dans le cas présent).

    Mais pour moi il est clair que ce genre d'expériences est a sous-traiter a des personnes spécialisées dans ce domaine surtout au vu du temps, du personnels et des moyens financiers requis.

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  17. #13
    Edelweiss68

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Je suis également chagrinée de cette attitude de filtrage par PS. Un forum est fait pour échanger et toute réponse est potentiellement bonne à prendre, si ce n'est pas pour vous cela peut être pour quelqu'un d'autre. Rien ne vous empêche de sélectionner les réponses qui vous conviennent a posteriori, sinon c'est vrai, ça fait très sélect. Bon, je m'égare...

    Mais à bon entendeur.

    PS : Vous connaissez la fable du lion et du rat ?
    H u m a n i t y

  18. #14
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par Edelweiss68 Voir le message
    Je suis également chagrinée de cette attitude de filtrage par PS. Un forum est fait pour échanger et toute réponse est potentiellement bonne à prendre, si ce n'est pas pour vous cela peut être pour quelqu'un d'autre. Rien ne vous empêche de sélectionner les réponses qui vous conviennent a posteriori, sinon c'est vrai, ça fait très sélect. Bon, je m'égare...

    Mais à bon entendeur.

    PS : Vous connaissez la fable du lion et du rat ?

    Ne sois pas chagrinée mon enfant ! C'est juste que quand tu as 30 réponses "unrelated" comme disent les anglais, avec des réponses du genre " t'as cherché dans google", ou encore "ché pas, mais je connais quelqu'un qui connait quelqu'un qui travaille dans ce domaine ...." , bin ca fait autant de mail d'alerte dans la boite mail ....

  19. #15
    Guillaume69

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par ribotao Voir le message
    On a tous été dans des instituts qui ont des plateformes de ci et de ca, moi pendant ma thèse, un de mes potes qui était assis juste à coté de moi, et avait sa paillasse à coté aussi, faisait sa thèse sur la protéomique .... mais ca fait pas de moi un expert ou un pro de protéomique pour autant ! .... si tu fais ton master recherche sur la génomique, tu réponds au critère ... cad celui de savoir de quoi tu parles en tant qu'opérationnel et/ou décideur !
    D'une part, je n'ai jamais dit être un expert.
    D'autre part, je ne savais pas qu'il y avait un critère autre que la pertinence de ses propres interventions pour juger de la pertinence des interventions de quelqu'un...

    J'ajoute enfin que mis à part des messages du type "c'est quoi un chromosome ?", personne n'envoie balader les gens en leur disant de chercher leur réponse sur google ou wikipedia sur ce forum.

    Mais si à l'avenir tu trouves que des étudiants nazes qui ne connaissent rien à rien polluent une discussion avec des interventions inadéquates ou fausses, tu peux utiliser la fonction de signalement d'un message prévue à cet effet...
    On sera ravi de voir ce qui il peut bien s'agir, car pour l'heure personne n'est en ligne de mire ...

  20. #16
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    et mon pt'i poto, du calme, primo, j'ai été étudiant avant toi, donc essaies de faire la distinction entre humour et 1er degré ... parce que si tu commences déjà à te la jouer, qu'est-ce ca va être une fois que aura ton doctorat !!!
    La seule manière louable de faire changer d'avis quelqu'un qui a des préjugés (qui pourrait être moi par exemple ), c'est pas de lui faire la morale, mais de montrer de quoi tu es capable ! Or en l’occurrence, tu parles beaucoup mais tu n'es pas très convaincant ! La jeune fille plus haut, "petite" assistante-ingénieur dans une boite de biotech m'a très sérieusement répondu avec des arguments solides (et je la remercie encore au passage !) .... alors que toi, avec ton bac+5, ... mis à part pleurnicher et pourrir ma discussion tu fais rien d'autre ! ... Allez bon courage et bonne chance pour la suite !

  21. #17
    JPL

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Mon devoir de modérateur est de dire que si cette discussion est en train de pourrir, la faute en revient à ribotao qui, quoi qu'il en pense, est parfaitement arrogant. Donc ou bien le ton devient plus cordial ou bien je n'aurai aucun scrupule à fermer une discussion que son initiateur pense indigne de la plupart de ceux qui fréquentent ce forum.

    Et pour éviter un dérapage je rappelle deux points importants de la charte du forum :
    Tout acte de modération est écrit en vert ; dans les autres cas les modérateurs s'expriment à titre personnel.
    Les critiques ou les commentaires sur la modération doivent être effectués en privé.
    Donc si tu n'es pas content tu t'adresses à moi directement par message privé.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  22. #18
    ribotao

    Re : sous-traiter une étude génomique (DNA chip) à une entreprise privée

    Citation Envoyé par JPL Voir le message
    Mon devoir de modérateur est de dire que si cette discussion est en train de pourrir, la faute en revient à ribotao qui, quoi qu'il en pense, est parfaitement arrogant. Donc ou bien le ton devient plus cordial ou bien je n'aurai aucun scrupule à fermer une discussion que son initiateur pense indigne de la plupart de ceux qui fréquentent ce forum.

    Et pour éviter un dérapage je rappelle deux points importants de la charte du forum :


    Donc si tu n'es pas content tu t'adresses à moi directement par message privé.

    Cher JPL,

    Je t'invite à cloturer cette discussion puisque j'ai eut les réponses que je voulais.

    Salutations,

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