Loi de distribution dans R
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Loi de distribution dans R



  1. #1
    invite7b1dcabe

    Loi de distribution dans R


    ------

    Bonjour,

    j'ai un jeu de données que je dois analyser sur le logiciel R et concernant la dynamique de populations de différentes souches de S. cerevisiae.

    J'ai différentes variables dont :
    - K, la capacité de charge
    - r, le taux de croissance
    - le milieu (i.e. la concentration de glucose dans le milieu (1 et 15%))
    - la souche
    - l'origine de la souche

    Je voudrais faire un modèle en utilisant K ou r (r étant peut-être plus pertinent et traduit peut-être mieux la notion de dynamisme des populations) en fonction des autres facteurs.

    Pour choisir la la loi de distribution, j'ai testé différents modèles sur R (je voulais ensuite comparer les AIC et choisir le modèle avec l'AIC le plus faible) :

    - Loi normale : sauf que ni K, ni r ne suivent une loi normale. Cependant, pas de problème pour faire le modèle mais les variables sont quasi toutes significatives.
    - Loi de Poisson : R me donne des messages d'erreur, une AIC infini, des variables quasi toutes signific atives
    - Loi binomiale : impossible à faire car K et r sont des variables continues (et K>1) (idem pour la loi bino miale négative)

    Voilà, je suis débutante sur R et ces lois de distribution sont les seules que je connaisse. Avez-vous une solution, un début de solution ?

    Aussi, je me demande si le fait que la plupart des variables (milieu, souche et origine) soit des facteurs (i.e. variables qualitatives) peut poser problème.

    D'avance, merci pour votre aide

    -----

  2. #2
    Guillaume69

    Re : Loi de distribution dans R

    D'expérience, pour les questions sur R, tu as plus de chance de trouver une réponse dans mathématiques du supérieur. Les gens calés sur R qui viennent sur le forum de bio sont très peu nombreux.

    Par contre il faudra adapter ton vocabulaire à des mathématiciens/informaticiens

  3. #3
    invite7b1dcabe

    Re : Loi de distribution dans R

    C'est noté!

    J'ai posé ma question sur le forum de maths. Pas de réponses pour l'instant cependant.

    Je ne suis pas spécialiste du langage des mathématiciens ou des informaticiens ; on verra s'ils daignent bien me répondre

    Sinon, je viens de voir qu'il existait un forum spécial pour les utilisateurs de R. Cependant, il faut attendre que le modérateur du site acceptent d'activer notre compte et ça a l'air de prendre du temps...

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