Le gene DSCAM de la drosophile...

[invite604a223a]

Bonjour tout le monde,


Je suis en classe de première S et je bloque sur un exercice depuis prés de deux heures...
Après de nombreuses recherches sur internet et sur le forum en vain, je viens vous implorer de aide!!!!

"Le gène DSCAM de la drosophile est constituée de 60000 nucléotides. Il contient 115 exons, parmi lesquels 20 sont présents dans tout les ARNm transcrits. Les 95 autres exons sont repartis en quatre groupes qui subissent un épissage alternatif pour ne conserver qu'un seul exon de chaque groupe. L'ARNm final est donc constitué d'un total de 24 exons.
Les quatre groupes d'exons subissant l’épissage alternatif contiennent respectivement 12, 48, 33, et 2 exons."

La question est: Calculez combien de protéines DSCAM différentes le drosophile peut produire.

Merci de votre aide!!!!!!
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[noir_ecaille]

Pour commencer, comment calculerais-tu et pourquoi ?

[invite604a223a]

Bonjour,

Justement, je n'ai aucune idée du calcul a faire... Pouvez-vous m’éclairer sur la piste a suivre?

Merci de votre réponse!!!!!

[noir_ecaille]

C'est moins de la biologie que des probabilités à ce niveau.

Déjà quelles sont selon vous les chiffres à retenir pour calculer, et pourquoi ?

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite604a223a]

J'utiliserais le "24 exons" et le "60.000 nucléotides"...
Mais je n'ai aucune certitude!

Merci de tes réponses si rapide!!!

[noir_ecaille]

Il y a beaucoup d'informations mais seules quelques unes sont utiles pour ce calcul. Les "60 000" nucléotides n'en font pas partie. Sur les 24 exons, quelle est la variabilité ?

[invite604a223a]

Que veux-tu dire par variabilité ?

Merci!!!

[invite604a223a]

En cherchant un peu sur le net, j'ai pu voir que le résultat était 38016... J'en ai donc déduit que le calcul a faire était la multiplication des quatre groupes d'exons subissant l'épissage alternatif, soit 12*48*33*2=38016.

Je n'avoue avoir aucune idée du pourquoi de cette multiplication...

[noir_ecaille]

Je n'avoue avoir aucune idée du pourquoi de cette multiplication...

Fôôôôteuh

Concernant la multiplication, c'est parce qu'on suit les lois probabilistes simples.

Sur les 115 exons utilisables, 24 formeront une protéine. On en a 20 qui ne changeront jamais, peu importe la protéine (probabilité de présence de ces exons de 100%), ce qui nous laisse QUATRE exons variables.

On sait que l'épissage pioche toujours dans quatre groupe d'exons -- donc on a autant de protéines qu'il y a de combinaisons possibles entre ces quatre groupes -- soit "comptabiliser" le nombre de combinaisons différentes


En espérant avoir éclairci la question

[invite604a223a]

Au temps pour moi, "j'avoue n'avoir (...)" serait plus approprié

, ce qui nous laisse QUATRE exons variables.

Quatre exons variables ou quatre GROUPES d'exons variables?

[invite604a223a]

Pas assez réfléchi, désolé. Je retire ma question, pour en poser une autre... Après c'est fini, promis!!!!

En quoi ce gène DSCAM montre l’intérêt de l'épissage alternatif?

Merci pour tout!!!

[noir_ecaille]

Qu'est-ce qui est le plus optimisé ? Avoir une usine par modèle de voiture ou plusieurs chaînes séparées de montage, éventuellement paramétrables ?

[invite604a223a]

La deuxième solution!! mais en quoi le fait qu'un gène puisse produire plusieurs protéines est quelque-chose de bien??

[noir_ecaille]

Ça prend moins de place, tout simplement. La cellule est tout petite, alors il faut optimiser l'archivage/encodage.

L'autre point positif éventuel, c'est l'apparition potentielle de nouvelles variations d'exons. Si on transposait à l'informatique, en gros l'ajout de fichiers dll, de mises à jour, etc. Ces ajouts de nouveaux variants d'exons à la "bibliothèque" existante peuvent se faire :
- soit par le biais d'une infection (virus, bactéries, parasites)
- soit par le biais de mutations (plus difficile)
- soit par l'intégration d'une séquence libre (exceptionnel)

[invite604a223a]

Je ne suis pas sur d'avoir tout compris...
Ma question est: Quel est l'avantage pour l'organisme, ou pour la cellule (quelle cellule?), ou pour le gène de pouvoir fabriquer 38016 protéines différentes ?

[noir_ecaille]

Avec le même gène ? Tu imagines, s'il fallait 38 016 gènes, la taille de la séquence génétique ???

Par contre si tu t'interroge sur le nombre final de protéines, interroge-toi d'abord sur leur rôle

[invite604a223a]

Oui, voilà!! En quoi la fabrication de 38016 protéines différentes va-t-elle engendrer quelque-chose de positif ?

[noir_ecaille]

Quel est le rôle de ces protéines ?

[invite604a223a]

Les protéines en général, aucune idée... Les protéines DSCAM, aucune idée non plus!