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séquençage



  1. #1
    Polysam

    séquençage


    ------

    Bonjour,
    mon objectif c'est de trouver des mutations dans le gène SRY.
    J'ai fait alors une PCR puis j'ai envoyé le produit PCR purifié au séquenceur.
    pouvez vous me dire comment je vais recevoir la séquence (dans quel format) et quelle sont les étapes pour lire les séquences par quels logiciels et comment chercher les mutations (les étapes de travail).
    s'il vous plait pouvez vous m'éclaircir et m'aider c'est très important.
    cordialement

    -----

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  4. #2
    Flyingbike
    Modérateur

    Re : séquençage

    Ca dépend de comment il sert séquence. Classiquement tu te retrouves avec un chromatogramme, avec ou sans fichier de séquence correspondant. Il existe plein de logiciels d'analyse des chromatogrammes. Pour chercher des mutations, le plus simple est d'aligner la séquence sauvage avec tes résultats de séquençages et de voir la ou ça ne colle pas. Là encore il existe plein d'outils software ou en ligne pour réaliser des alignements multiples de séquence.

  5. #3
    Polysam

    Re : séquençage

    merci mon ami mais s'il vous que voulez vous dire de cette phrase "il sert séquence"?

  6. #4
    kamor

    Re : séquençage

    Je pense que Flyingbike devait déguster son gouter en même temps ce qui lui a fait écrire cette petite erreur sans se corriger
    Il devait surement vouloir écrire "Ça dépend du séquenceur dont ils se servent"

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