Répondre à la discussion
Affichage des résultats 1 à 3 sur 3

mystère de séquences...



  1. #1
    cleville

    mystère de séquences...

    bonjour,
    Après séquençage de 3 génotypes avec la même amorce, nous avons 3 séquences qui a parti du même endroit, a un décalage d'environ 15 bases (je n'ai plus le nombre exactes mais c'est le même pour les 3).
    Sur le chromatogramme, nous avons donc le même début de séquence puis 2 séquences qui se superposent.....

    bref une base ça s'explique mais là

    -----


  2. #2
    Svenn

    Re : mystère de séquences...

    Citation Envoyé par cleville Voir le message
    bonjour,
    Après séquençage de 3 génotypes avec la même amorce, nous avons 3 séquences qui a parti du même endroit, a un décalage d'environ 15 bases (je n'ai plus le nombre exactes mais c'est le même pour les 3).
    Sur le chromatogramme, nous avons donc le même début de séquence puis 2 séquences qui se superposent.....

    bref une base ça s'explique mais là
    Ca sent très fortement la séquence répétée. Ton amorce se fixerait à plusieurs endroits, tant que tu es dans la région répétée ta séquence semble normale et quand tu atteinds les régions variables, tu obtiens un mélange de séquences. Utilise le programme blast en donnant comme élément à rechercher ton amorce (ou mieux, un segment de 50 nucléotides issus de la partie propre de la séquence).

  3. #3
    cleville

    Question Re : mystère de séquences...

    le hic c'est qu'il n'est pas censé y avoir de séquences répétées dans cette région.

Sur le même thème :

Discussions similaires

  1. [Biologie Moléculaire] Séquences d'insertion !!!! *
    Par cysto dans le forum Biologie
    Réponses: 3
    Dernier message: 23/12/2009, 15h32
  2. [Biologie Moléculaire] séquences régulatrices
    Par Adorise dans le forum Biologie
    Réponses: 1
    Dernier message: 23/04/2009, 14h27
  3. Séquences consensus
    Par topullinu dans le forum Biologie
    Réponses: 5
    Dernier message: 01/04/2009, 18h56
  4. dans un trou noir (mystere grand mystere!)
    Par clanki357 dans le forum Archives
    Réponses: 49
    Dernier message: 21/11/2007, 07h06
  5. Sequences répétées
    Par Barbanath dans le forum Biologie
    Réponses: 2
    Dernier message: 25/05/2006, 10h32