bonjour,
Après séquençage de 3 génotypes avec la même amorce, nous avons 3 séquences qui a parti du même endroit, a un décalage d'environ 15 bases (je n'ai plus le nombre exactes mais c'est le même pour les 3).
Sur le chromatogramme, nous avons donc le même début de séquence puis 2 séquences qui se superposent.....
bref une base ça s'explique mais là
Ca sent très fortement la séquence répétée. Ton amorce se fixerait à plusieurs endroits, tant que tu es dans la région répétée ta séquence semble normale et quand tu atteinds les régions variables, tu obtiens un mélange de séquences. Utilise le programme blast en donnant comme élément à rechercher ton amorce (ou mieux, un segment de 50 nucléotides issus de la partie propre de la séquence).Envoyé par cleville
bonjour,
Après séquençage de 3 génotypes avec la même amorce, nous avons 3 séquences qui a parti du même endroit, a un décalage d'environ 15 bases (je n'ai plus le nombre exactes mais c'est le même pour les 3).
Sur le chromatogramme, nous avons donc le même début de séquence puis 2 séquences qui se superposent.....
bref une base ça s'explique mais là
Re : mystère de séquences...
le hic c'est qu'il n'est pas censé y avoir de séquences répétées dans cette région.
