Réactions catalysées par une kinase

[invitead0a9c62]

Bonjour,

Dans mon cours il nous est demandé de choisir 2 des réactions suivantes qui sont catalysées par une kinase.
A) ATP + H₂O --> ADP + Pi (groupement phosphate)
B) Fructose-6-phosphate+ ATP --> Fructose-1,2-biphosphate + ADP
C) Phosphoénolpyruvate + ADP --> pyruvate+ ATP
D) Glucose-6-phosphate + H₂O --> glucose + Pi
E) ARNt + acide aminé + ATP --> ARNt-acide aminé+ AMP + 2Pi

Je sais que la kinase est une enzyme qui fait partie de la famille des transférases et que lors de cette réaction il y'a transfère d'un groupement phosphate.
Mais alors si je refléchis comme ça pour moi toutes les propositions ci-dessus sont bonnes pour moi..
Si quelqu'un savait m'aider sur cette question ça serait vraiment bien
-----

[inviteb7fede84]

Message transféré en biologie

[invitea142fd95]

Bonjour,

Les kinases sont des enzymes qui catalysent les phosphorylations uniquement, c'est-à-dire l'addition d'un groupe phosphate. Tu n'as plus qu'à regarder tes réactions et à voir lesquelles présentent une phosphorylation

[invitead0a9c62]

ET ben justement, pour moi, j'ai l'impression que toutes ces réactions présentent une phosphorylation! J'arrive vraiment pas à voir clair dans cet exercice

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitea142fd95]

L'hydrolyse de l'ATP est-elle une phosphorylation ?
Tu passes de l'ATP (donc 3 phosphates) à une molécule d'ADP (deux phosphates) et libération d'un phosphate inorganique, ça ne ressemble donc pas à une phosphorylation, c'est-à-dire l'ajout d'un PO4 (enfin c'est ce que j'en pense...)

[invite71f23525]

un autre coup de pouce : hydrolyse = lyse par l'eau (c'est un peu plus compliqué, mais dans le bilan c'est ça )...

[noir_ecaille]

En cherchant dans les voies de dégradation enzymatique du glucose, soit glycolyse et cycle de Krebbs, on peut écarter certaines équations ^^

[invitef6c1d3c5]

L'hydrolyse de l'ATP est-elle une phosphorylation ?
Tu passes de l'ATP (donc 3 phosphates) à une molécule d'ADP (deux phosphates) et libération d'un phosphate inorganique, ça ne ressemble donc pas à une phosphorylation, c'est-à-dire l'ajout d'un PO4 (enfin c'est ce que j'en pense...)

Pas vraiment, l'ajout d'un phosphate par une kinase nécessite un donneur de phosphate, en occurrence de l'ATP, qui est hydrolysé en ADP+Pi, Pi qui est ensuite ajouté au substrat.

Donc une kinase réalise bien une hydrolyse, mais pas uniquement ...

[vpharmaco]

message annule..

[vpharmaco]

Pas vraiment, l'ajout d'un phosphate par une kinase nécessite un donneur de phosphate, en occurrence de l'ATP, qui est hydrolysé en ADP+Pi, Pi qui est ensuite ajouté au substrat.

Donc une kinase réalise bien une hydrolyse, mais pas uniquement ...

Tu as un exemple de cela?
Pour les kinases que j'ai en tete (mais il y a peut etre des contre-exemples), c'est le substrat qui va induire la rupture de la liaison phosphodiester de l'ATP via une reaction-d'addition/elimination (exemple des Tyrosine- ou Ser/Thr kinases). Cette reaction se fait sans intervention d'eau.

[noir_ecaille]

Des schémas, des schémas, des schémas

[invite71f23525]

Tu as un exemple de cela?
Pour les kinases que j'ai en tete (mais il y a peut etre des contre-exemples), c'est le substrat qui va induire la rupture de la liaison phosphodiester de l'ATP via une reaction-d'addition/elimination (exemple des Tyrosine- ou Ser/Thr kinases). Cette reaction se fait sans intervention d'eau.

Cela veut dire alors que lorsqu'on parle d'hydrolyse pour certaines réactions enzymatiques, c'est un abus de langage (ou une simplification pour nous, pauvres biologistes que nous sommes )?

[vpharmaco]

Non, non.. les biochimistes ne sont pas vicieux a ce point Une hydrolyse fait bien intervenir de l'eau, sinon ce n'est plus une hydrolyse.

Par contre, une kinase est une transferase. Elle transfert un groupement phosphate d'un donneur (par exemple l'ATP) a un substrat (au niveau d'une fonction alcool, thiol, amine, phenol, imidazole...). Le transfert est "direct". Il n'y a pas hydrolyse, formation de phosphate inorganique (Pi), puis condensation du Pi avec le substrat. (Si la cellule s'embete a creer de l'ATP, ce n'est pas pour l'hydrolyser juste avant la phosphorylation )

On trouve une grosse revue sur le mechanisme des proteine-kinases ici : http://www.audreyli.com/panli/chemis...1_101_2271.pdf
Pour ceux qui n'ont pas trop l'envie de tout lire, la figure 2 montre comment l'enzyme met tous les elements en place au sein de son site actif, et la figure 4 montre l'etat de transition lors du transfert (NB: la partie ADP de l'ATP constitue un bon groupe partant dans cette reaction - Si on avait a la place de l'ATP du phosphate inorganique, il faudrait eliminer OH^- ce qui est bien bien plus difficile)

[vpharmaco]

La meme chose avec des fleches et des couleurs http://www.google.com/imgres?imgurl=...9QEwBA&dur=154
C'est tout de meme plus joli !

[invitead0a9c62]

Merci encore pour toutes ces explications. Alors si j'ai bien compris, pour moi les 2 réactions catalysées par une kinase sont la B et la C?
B) Fructose-6-phosphate+ ATP --> Fructose-1,2-biphosphate + ADP
C) Phosphoénolpyruvate + ADP --> pyruvate+ ATP

[invitef6c1d3c5]

Non, non.. les biochimistes ne sont pas vicieux a ce point Une hydrolyse fait bien intervenir de l'eau, sinon ce n'est plus une hydrolyse.

Par contre, une kinase est une transferase. Elle transfert un groupement phosphate d'un donneur (par exemple l'ATP) a un substrat (au niveau d'une fonction alcool, thiol, amine, phenol, imidazole...). Le transfert est "direct". Il n'y a pas hydrolyse, formation de phosphate inorganique (Pi), puis condensation du Pi avec le substrat. (Si la cellule s'embete a creer de l'ATP, ce n'est pas pour l'hydrolyser juste avant la phosphorylation )

On trouve une grosse revue sur le mechanisme des proteine-kinases ici : http://www.audreyli.com/panli/chemis...1_101_2271.pdf
Pour ceux qui n'ont pas trop l'envie de tout lire, la figure 2 montre comment l'enzyme met tous les elements en place au sein de son site actif, et la figure 4 montre l'etat de transition lors du transfert (NB: la partie ADP de l'ATP constitue un bon groupe partant dans cette reaction - Si on avait a la place de l'ATP du phosphate inorganique, il faudrait eliminer OH^- ce qui est bien bien plus difficile)

Bah merde alors :s j'étais pourtant sur le moi, mes cours d'enzymo ont beau être assez loin je pensais être dans le vrai.

Mea culpa donc :s

J'vais retourner à mes ARN moi

[invite71f23525]

Merci pour ces renseignements très instructifs vpharmaco!