bioinformatique dot plot
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bioinformatique dot plot



  1. #1
    killboul

    bioinformatique dot plot


    ------

    bonjour,

    est ce que quelqu'un pourrait m'éclairer un peu sur la technique du dot plot. en particulier sur la signification des diagonales et anti diagonales.
    si j'ai bien compris les anti diagonales représentent une portion de séquence qui est identique pour deux séquences , mais que représentent les diagonales?
    merci pour votre aide

    -----

  2. #2
    toothpick-charlie

    Re : bioinformatique dot plot

    les diagonales sont des séquences identiques, et les "antidiagonales" (je ne connaissais pas ce terme) des séquences identiques mais dont l'une est inversée par rapport à l'autre.

  3. #3
    killboul

    Re : bioinformatique dot plot

    merci de votre réponse . mais qu'elle information peut on retirer de deux séquences inversées ou antidiagonale? car on ne peut pas les aligner.

  4. #4
    toothpick-charlie

    Re : bioinformatique dot plot

    ça signifie qu'il y a eu un événement d'inversion. Si tu utilises un modèle d'évolution moléculaire, par exemple pour estimer une phylogénie par maximum de vraisemblance, tu peux attribuer une probabilité à cet événement.

  5. A voir en vidéo sur Futura

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