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calcul d'efficacité de PCR




  1. #1
    olivenaelle

    calcul d'efficacité de PCR

    Bonjour,
    jai une petite question sur le calcul de l'efficacité d'une PCR
    est il possible de la calculer sans connaitre la concentration de l'ADN de départ, juste en calculant la pente de la droite : Ct en fonction du log du facteur de dilution ? (en valeur absolue bien sure)

    -----

    Dernière modification par olivenaelle ; 12/12/2012 à 16h06.

  2. Publicité
  3. #2
    Flyingbike

    Re : calcul d'efficacité de PCR

    oui, à partir de la pente :


    Voir l'explication ici (document réalisé par la plate forme génomique de l'institu Cochin)

    http://cochin.inserm.fr/research/tec...de-la-PCRq.pdf

  4. #3
    olivenaelle

    Re : calcul d'efficacité de PCR

    re-bonjour,
    merci pour ce doc j'y avais déjà jeté un oeil mais ce qui me chagrinais c'est qu'il parle de C0 (concentration initial connue par l'expérimentateur) dans leur explication, et dans leur exemple il aborde que le passage le calcul de l'efficacité de la PCR avec le standard la myoglobine donc la concentration est connue en revanche pour le gène X rien.
    olivier


  5. #4
    random_postdoc

    Re : calcul d'efficacité de PCR

    Comme dit au dessus, pour calculer l'efficacité d'une PCR, pas besoin de connaitre la concentration exacte de ton échantillon standard. Tu peux par exemple attribuer une valeur arbitraire "1" au standard non dilué, puis faire les dilutions comme ca te chante par la suite (dilution en série par 4 ou 10 ou autres), et le calcul de la pente te permettra de calculer l'efficacité.

    C'est valable pour les quantifications relatives. Pour une quantification absolue il te faudra par contre des standards de concentration connue.

  6. #5
    olivenaelle

    Re : calcul d'efficacité de PCR

    OK merci de vos réponses,
    c'est vrai qu'en y réfléchissant je trouve cela logique car c'est la pente qui sert à la base du calcul
    bonne journée à vous !!!!!
    olive

  7. A voir en vidéo sur Futura

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