Bonjour tout le monde,
J'ai une petite question concernant la traduction de l'ARN :
Il est apparemment possible dans une séquence codante d'identifier le domaine extra-cellulaire, intra et transmembranaire de la future protéine.
Quelqu'un pourrait m'expliquer comment procéder ?
Merci d'avance.
un exemple très simple = si dans la séquence prédite il y a des domaines entiers plutot hydrophobes, il y a des chances que cette partie soit transmembranaire. Ensuite on peut aller plus loin en regardant la présence de peptide signal, ou encore par analogie avec des protéines existantes, etc.
Super j'y avais pas pensé du tout.
Et pour différencier intra et extra cellulaire je fais comment ?
Et par rapport au peptide signal, il est souligné dans la séquence. Il m'apporte quoi comme information ?
regarde ici : http://fr.wikipedia.org/wiki/Inserti...s_membranaires
Si je fais une synthèse de l'article j'obtiens :
- la partie hydrophobe est membranaire
- la partie la plus positive (ie avec le plus d'acides aminés basiques) est intra-cellulaire SAUF si le peptite signal est très hydrophobe.
Je suis dans le vrai ou pas du tout ?
c'est l'idée MAIS la théorie ne se vérifie pas toujours. Ainsi la présence d'un domaine hydrophobe peut très bien correspondre à un domaine profond dans une protéine soluble et n'a rien a voir avec un domaine transmembrannaire.
D'accord, merci !
