petit sillon

[Kyle_XY]

Bonjour à tous , je voulais savoir si le petit sillon était quand même accessible par les enzymes ou s'il y avait un quelconque processus pour y avoir avoir ?
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[noir_ecaille]

Le petit sillon de quoi ?

[minou3]

Le petit sillon de l'ADN, j'imagine...

[TheBigBangTheory]

Bonjour,

La réponse est oui, mais cela reste rare.

[A voir en vidéo sur Futura]

[Kyle_XY]

pourquoi rare ? ce sont des régions rarement transcrites ?

[TheBigBangTheory]

(Non rien à voir avec les régions transcrites ou non transcrites)

Le petit sillon, par rapport au grand sillon, a une configuration spatiale très étroite. Et dans le grand sillon, les atomes nucléophiles des bases puriques sont très bien exposées vers l'extérieur. Ceci facilite la liaison (liaisons hydrogène) à d'autres protéines, donc à des enzymes.

[Kyle_XY]

merci. Je me demandais aussi puisque les enzymes de réparation effectuent leur travail après que tout l'ADN ait été répliqué , si elles devaient enlever un nucléotide incorrect qui se trouve dans le petit sillon; comment font elles puisque de l'extérieur elles n'ont pas accès aux plateaux de bases ?

[TheBigBangTheory]

Je t'avais parlé du mécanisme NER sur l'autre sujet, en te parlant de la protéine TF2H.
Et bien cette TF2H a justement la particularité de se lier à l'ADN par le petit sillon.
Ceci étant, petit sillon ou grand, la réparation avec resynthèse nécessite un déroulement de l'ADN, donc il n'y a pas plus de grand ou de petit sillon.

[Kyle_XY]

Je vais essayer de retrouver ce post. Je pensais qu'il y avait un mécanisme particulier où il n'y avait pas besoin de dérouler l'ADN comme c'est le cas avec uracile DNA glycosilase par exemple

[Kyle_XY]

(Non rien à voir avec les régions transcrites ou non transcrites)

Le petit sillon, par rapport au grand sillon, a une configuration spatiale très étroite. Et dans le grand sillon, les atomes nucléophiles des bases puriques sont très bien exposées vers l'extérieur. Ceci facilite la liaison (liaisons hydrogène) à d'autres protéines, donc à des enzymes.

qu'entendez-vous par atomes nucléophiles des bases puriques ? ( et pas les bases pyrimidiques ? )