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Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques



  1. #1
    dams7325

    Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques


    ------

    Bonjour,

    Certaines protéines interagissant ensemble peuvent être dissociées par l'ajout de sel (en solution). J'imagine que les ions de ce sel solvatés en solution peuvent interagir avec certains acides aminés afin d'empêcher l'interaction protéine 1 protéine 2 (donc une interaction électrostatique) mais je me demande quels acides aminés sont capables de réaliser ces types de liaisons : je dirais acide aspartique et glutamique, lysine, histidine et arginine. Qu'en pensez-vous?
    Merci d'avance

    -----

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  3. #2
    Arion8

    Re : Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

    Par définition, il s'agit de tous les acide aminé polaires (dans ce cas c'est d'ailleurs un synonyme de hydrophiles). Voilà un petit tableau résumant grossièrement cela (évidement plus la valeur est grande plus l'interaction est probable/importante)hydrophob.jpg

    Et pour la source :
    Kyte J. and Doolittle RF. A simple method for displaying the hydropathic character of a protein. Journal
    of Molecular Biology, 157(1):105–32, May 1982.

    J'espère que cette réponse te convient, n'hésite pas a poser d'autre question pour des détail (c'est un sujet qui me plait )

    Je rajouterai qu'a des pH "exotiques", certains acides aminé peut voir leur charge changer ce qui modifie évidement leur propriétés électrostatique.
    Dernière modification par Arion8 ; 03/12/2013 à 17h51.

  4. #3
    dams7325

    Re : Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

    Merci de ta réponse, en fait il s'agit de liaisons hydrogènes (j'ai oublié de le préciser) et du coup c'est bien des liaisons qui se forment entre des acides aminés polaires (présentant des groupements OH (H donneur, O accepteur) NH (N accepteur, H donneur) c=O (accepteur) N (accepteur)). Par contre je ne sais pas trop pour la cystéine (le soufre en particulier est-il capable de participer aux liaisons H)?
    Merci d'avance

  5. #4
    Arion8

    Re : Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

    Le groupement S-H n'est pas réellement capable de réaliser une liaison H car considéré comme apolaire. En réalité cette liaison est faiblement polaire, mais suffisamment peu pour qu'on considère les charges partielles nulles (selon l'échelle de Pauling : H : 2.1; S: 2.5 et O : 3.5, or par convention on désigne comme apolaire (covalentes simples) des liaisons dans lesquelles la différence électronégativité est inférieur ou égale a 0.4). Alors qu'avec une différence d’électronégativité de 1.4, la liaison O-H est une liaison dite covalente polaire, donc capable de former des liaisons hydrogènes.
    Dernière modification par Arion8 ; 03/12/2013 à 19h05.

  6. #5
    vpharmaco

    Re : Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

    Ne pas oublier aussi que les protéines n’interagissent pas uniquement au moyen de la chaine latérale de leurs acides aminés. Le squelette peptidique d'une protéine, avec ses fonctions amides, peut également établir des liaisons H avec d'autres protéines

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    vpharmaco

    Re : Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

    doublon............

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  10. #7
    dams7325

    Re : Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

    Merci pour cette précision, et sinon je savais pour la chaîne peptidique (merci quand même =) ).

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