Sens de lecture d'un plasmide

[Aqualung]

Bonjour à tous,

Je me renseigne sur la construction de plasmide et l'insertion de gène par digestion-ligation.

Je tente de faire une construction à l'aide d'un programme et j'ai trouvé la séquence de mon plasmide. J'ai repéré les sites de restriction à utiliser qui seront de part et d'autre de mon gène.

Seulement je me pose la question de l'orientation de mon gène. Tout d'abord comment savoir où se trouve le 5' et où se trouve le 3' du plasmide? J'ai une séquence qui est numérotée de 1 à 5369. Le 5' commence toujours en 1?

Ensuite, une fois que j'insère le gène, comment savoir quel brin sera lu? Je dois intégrer la séquence antisens ou la séquence sens? Quel critères dois-je regarder pour savoir ça?

Merci d'avance pour vos réponses
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[Yoyo]

Salut

Tout est une question de convention. En général et par simplification on écrit le brin codon de gauche à droite.

Yoyo

[Aqualung]

Bonjour Yoyo, merci pour la réponse,

De plus je pense avoir trouvé le reste de la réponse, en effet on écrit de gauche à droite e mais en plus il me suffit de voir où se situe le promoteur et le terminateur et j'aurais l'orientation du gène