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nombre de genes minimum



  1. #1
    fluff
    bonjour
    est ce que qqn connait l'organisme unicellulaire qui comporte le moins de genes?
    en ne tenant pas compte des organismes parasites qui utilisent d'autres etres vivants pour vivre.
    ou bien si vous disposez de liens sur la question cela m'interesse aussi!
    au plaisir de vous lire

    -----

  2. Publicité
  3. #2
    Yoyo
    salut,

    Ce nombre de gene minimum est evalue a environ 400. en fait entre 250 et 400.

    voici quelques liens:
    http://anthro.unige.ch/evolution/gen00017.htm

    et une citation:
    Citation Envoyé par Olivier Blond
    Au cours des années 80, plusieurs organismes vivants ont semblé dignes de remporter le titre de "plus petit et plus simple organisme capable de s'autorépliquer". Mais c'est seulement en 1995, grâce aux séquençages successifs du génome de deux bactéries différentes, que des chercheurs du Centre américain pour les Biotechnologies de l'Information ont calculé que le génome minimal nécessaire à la vie devait être de 252 gènes exactement. C'est en fait le nombre de gènes que les deux bactéries en question, ayant divergé génétiquement il y a au moins 1,5 milliards d'années, possèdent en commun. En provoquant des mutations au hasard sur le génome de l'une des 2 bactéries en question, ces mêmes chercheurs ont d'ailleurs confirmé ce premier résultat, montrant par approximation que, seules, les mutations portant sur quelque 254 gènes empêchent la bactérie de se développer. Reprenant la méthode à plus grande échelle, l'équipe de Craig Venter, celle qui vient de séquencer le génome humain, a inactivé un à un tous les gènes de cette même bactérie. Les chercheurs ont alors obtenu un nombre minimum de gènes compris entre 265 et 351. La validation de cette expérience nécessiterait la reconstruction du génome en entier, et son introduction dans une membrane cellulaire. Cependant, il s'agirait de créer une vie artificielle, projet nécessitant une connaissance approfondie des autres compartiments cellulaires (dont les protéines, les lipides et les sucres) que l'on est loin de posséder.

    En conclusion à ces recherches, peut-on effectuer une équivalence entre le génome minimal d'une bactérie et celui des premières cellules apparues au tout début de l'histoire de la vie ? Le fait est que la plupart des gènes "minimaux" dénombrés chez les bactéries possèdent des équivalences chez les eucaryotes (dont nous faisons partie) et les archaebactéries, c'est-à-dire la globalité des êtres vivants.

    "La vie : combien de gènes?"
    La Recherche, n°336, , novembre 2000, p.39-41
    citation trouvee ici

    Yoyo

  4. #3
    charlie
    Bonjour,

    je suppose que tu veux parler des êtres vivants sensus stricto parce qu'il me semble qu'il y a un virus (qui parasite les céréales je crois) qui n'a que 2 gènes. ou alors j'ai mal compris...

    C
    Soon, oh soon the light, ours to shape for all time, ours the right; the sun will lead us.

  5. #4
    John78
    Bonjour

    Je suis moyennement d'accords avec les réponses précédentes. Il y a en effet une différence entre le stock minimal de genes estimés et le stock minimal connus chez un microorganisme. Dans le premier cas on regarde les génes universellement conservé et on en déduit un "stock essentiel". Mais en réalité il faudrait regarder le nombre de *fonction* minimale, car de nombreux gènes non-homologues sont des analogues fonctionnels. Et là problème, car on est très loin de connaitre les fonctions de tout les gènes du vivant !

    Il est plus prudent de regarder les plus petit génomes connus. Se sont généralement des symbiotes. Le plus petit connu est une Archae, Nanorchaeum, avec un génome minuscule de 500kb et a peu pret 500 gènes. On connait quelques bactéries avec des génomes de taille proche.

    Pour répondre à Charlie, le nombre minimal de gène d'un virus c'est zéro. Ben oui, les virus ARN satelites de plante ne codent pour rien a part une origine de réplication et ont besoin d'un virus co-infectant (helper) pour tout !

    A+
    John

  6. #5
    Neutrino
    La réponse de John78 est excellente

    Si on veut faire un compte d'épicier, en comptant le nombre de gènes minimal d'une bactérie pour qu'elle vive dans des conditions paradisiaques...
    - les gènes d'ARN ribosomaux et de transfert
    - les gènes de polymérases, d'hélicases etc... (enzymes de réplication, de transcription...) + facteurs associés et répresseurs de gènes...
    - les gènes des métabolismes énergétiques : allez, soyons économes, on ne prend que les enzymes de la glycolyse et de la fermentation alcoolique
    - les gènes de synthèse des acides aminés, des constituants de la membrane...

    La question est : les bactéries ont elles autant de génome superflu que ça?
    Neutrino

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    John78
    Citation Envoyé par Neutrino
    La question est : les bactéries ont elles autant de génome superflu que ça?

    Ben faut croire car pas mal de bactérie ont des génomes 10x plus gros, avec 10x plus de gène. Et avec pas mal de redondance fonctionnelle (2 gène différent codant 2 fonctions identique) et beaucoup de gènes orphelins (aucun homologue connus a part la bactos en question) et aussi souvent non-essentiel (muté la bactérie survit). Il doit certainement y avoir un rapport avec des adaptations à certaines conditions, mais celà reste un point fortement discuté en génomique évolutive....

    A+
    John

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  10. #7
    charlie
    Bonjour,

    Pour répondre à Charlie, le nombre minimal de gène d'un virus c'est zéro. Ben oui, les virus ARN satelites de plante ne codent pour rien a part une origine de réplication et ont besoin d'un virus co-infectant (helper) pour tout !
    merci!

    C
    Soon, oh soon the light, ours to shape for all time, ours the right; the sun will lead us.

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