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Exercice PCR



  1. #1
    nrj06

    Exercice PCR

    Bonjour, je dois donner la taille des séquences (pb) qui seront amplifiées par PCR pour chacune des associations possibles des amorces utilisées :
    Amorces 1-2
    Amorces 1-3
    Amorces 1-4
    ...

    Je vous ai joint la séquence en pièce jointe.

    Je ne comprends pas à partir d'où il faut commencer à compter, par exemple pour l'amorce 1-2 je compte les nucléotides entre les 2 amorces ou je prends aussi en compte les nucléotides des amorces 1 et 2 ?

    Merci

    -----

    Images attachées Images attachées

  2. Publicité
  3. #2
    Flyingbike

    Re : Exercice PCR

    Les amorces sont incorporées dans l'amplicon. Le produit de PCR à la taille comprise entre le 5' de l'amorce forward et le 3' de l'amorce reverse
    La vie trouve toujours un chemin

  4. #3
    nrj06

    Re : Exercice PCR

    Ok merci

  5. #4
    nrj06

    Re : Exercice PCR

    Pour la taille de l'amplifiât pour l'amorces 2-3 c'est 21 ou 0 ?

  6. #5
    nrj06

    Re : Exercice PCR

    Pour l'amorces 1-4, comme l'amorce 4 est anti-sens, je dois pas compter jusqu'au bout (c) mais m'arrêter au début, c'est bien ça ?

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Flyingbike

    Re : Exercice PCR

    Pour la taille de l'amplifiât pour l'amorces 2-3 c'est 21 ou 0 ?
    ca n'a pas trop de sens, les amorces vont s'hybrider et il n'y aura pas d'amplification.

    Pour l'amorces 1-4, comme l'amorce 4 est anti-sens, je dois pas compter jusqu'au bout (c) mais m'arrêter au début, c'est bien ça ?
    non, l'amorce antisens est incluse

    par contre 1-2, vu que les deux amorces sont sur le même brin, il n'y aura aucune amplification

    pareil pour 3-4 par exemple.
    La vie trouve toujours un chemin

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  10. #7
    nrj06

    Re : Exercice PCR

    Les amorces sont sur le même brin ? Je suis pas sur d'avoir compris


    La taille de l'amplifiat pour les amorces 1-2 et 1-3 est alors le même ?

  11. #8
    Flyingbike

    Re : Exercice PCR

    deux amorces sens (ou antisens) sont sur le même brin. Pour que la PCR fonctionne il faut que les amorces soient chacune complémentaire d'un des brins.

    Regardez cette animation : si les deux amorces sont choisies sur le même brin et donc s'hybrident du même coté, il n'y a pas d'ammplification

    CH391L_S12_PCR_process.gif
    La vie trouve toujours un chemin

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