Étude d'un microorganisme non cultivable?

[benmrad]

Bonjour,
On sait que pour étudier un microorganisme tel un virus, l'étape de la culture in vitro est inévitable comme dans le postulat de Koch.
Alors comment faire pour établir une étude clinique sur un virus non cultivable?

Merci d'avance
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[Loupsio]

On ne peut tout simplement pas

En même temps si tu détecte un virus, c'est qu'il fait parler de lui parce que il fait des ravages dans une population et tue les individus, (ou au moins, montre des signes manifeste de son existence, même s'il ne tue pas, un peu comme le virus de l'herpes) et donc si tu le détecte, c'est qu'il y a moyen de le cultiver (dans des celllules hotes, par exemple sur des lapins si c'est un virus présent chez les lapins) et si on ne connait aucun de ses hotes potentiel, c'est qu'on a pas connaissance de l'existence même de ce virus, donc on ne peut pas chercher a étudier ce virus si on ne sait meme pas qu'il existe. Mais si c'est pour étudier un virus inconnu qui se développe dans une population, pour moi il suffit de le cultiver sur des cellules de cette population (ou sur les individus directement).

Tu parlais de culture in vitro, pour moi c'est sur boite de pétri ou dans des tubes, quand on parle d'in vitro, mais pour un virus de toute facon on est obligé de le cultiver sur des cellules, car un virus ne poussera jamais peu importe le milieu gélosé que tu lui offrira, il n'a pas les moyens de se répliquer, il doit intégrer obligatoirement des cellules vivantes pour se reproduire, a partir de la pour moi c'est pas de l'in vitro, c'est du semi in vivo, donc un virus en in vitro c'est tout bonnement impossible, meme avec un virus connu (après peut etre que ca dépend du sens donné à "in vitro"), mais ducoup il suffirait pour moi de le mettr en culture dans son hote, et faire des prélèvements sanguins ou cellulaires pour l'isoler ensuite et pouvoir l'étudier

Concernant les bactéries, il paraîtrait qu'une grande majoritée des bactéries existantes ne sont pas connus, car nous ne pouvons pas les faire pousser sur milieu gélosé, et donc impossible de les isoler et les étudier

[Flyingbike]

Il y a des alternatives a l'impossibilité de cultiver : par exemple le séquençage peut en dire long !

En ce qui concerne la distinction in vivo/in vitro, ce qu'on fait en culture cellulaire est clairement in vitro.

[Loupsio]

Il y a des alternatives a l'impossibilité de cultiver : par exemple le séquençage peut en dire long !

Si tu parles de métagénomique, (car à part la métagenomique, si tu veux séquencer ton individu, il faut deja en avoir une certaine quantité, et l'avoir isolé tout de même) ca ne permet pas grand chose, a part en étude de pop, ou des études de génomiques pures et dures
si le but est de carctériser un virus en particulier (ou une bactérie en particulier) qui plus est, qui est "inconnu", la métagénomique ne sera pas d'une grande aide

En ce qui concerne la distinction in vivo/in vitro, ce qu'on fait en culture cellulaire est clairement in vitro.

sur culture cellulaire, mais si on cultive directement dans l'animal, et ensuite qu'on extrait.... (je travail sur plante, donc pour moi la plante est cultivée in vitro, mais si on injecte un virus dans la plante, le virus et cultivé in vivo... après la terminologie...)

[A voir en vidéo sur Futura]

[Flyingbike]

par analogie de séquence, on peut tirer pas mal d'informations, des fonctions, etc. mais oui, on est d'accord

merci pour la précision, effectivement la terminologie n'est pas parfaitement définie