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Trouver les codons rares d'un organisme



  1. #1
    MonsieurB98

    Trouver les codons rares d'un organisme


    ------

    Bonjour, en ce moment je travaille sur un projet de biologie synthétique qui consiste à faire produire une substance par Corynebacterium Glutamicum.
    Du coup, je voulais savoir si vous connaissez un programme ou un site internet qui me permettrait de connaître les codons rares chez cette bactérie. Je compte y insérer cinq gènes, trois provenant de plantes et deux d'E. Coli.

    Merci d'avance !

    -----

  2. #2
    Matdu17

    Re : Trouver les codons rares d'un organisme

    Salut !
    Si ce que tu cherches à faire c'est optimiser les codons d'un transgène il y a plein de sites internet qui font ça, moi j'utilise https://eu.idtdna.com/CodonOpt, c'est un fournisseur d'oligos, ARN guides etc... et son outil d'optimisation de codons contient bien Corynebacterium glutamicum.

  3. #3
    MonsieurB98

    Re : Trouver les codons rares d'un organisme

    Super, merci beaucoup ! Ca me convient.

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