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Urgent : Ssp Pcr



  1. #1
    youtopik

    Question Urgent : Ssp Pcr


    ------

    Bonjour à tous,

    quelqu'un pourrait il me dire en quoi consiste une SSP PCR pour (single specifique primer - PCR). je ne trouve rien d'explicite sur le net.

    est ce que cela signifie que l'on utilise qu'une seule amorce comme pour un sequençage ?

    ou bien 2 amorces dont une specifique mais dans ce cas, à quoi correspond la seconde amorce ?

    et quelles sont les applications ce cette méthode comparée a une PCR classique ?

    merci d'avance pour vos réponses

    -----

  2. #2
    youtopik

    Re : Urgent : Ssp Pcr

    SVP, personne ne peut m'aider ?

  3. #3
    Elendilmir

    Re : Urgent : Ssp Pcr

    LSSP-PCR, si c'est cela que tu recherches, semble être uue methode d'études des polymorphismes, un peu à la manière d'un séquençage. C'est une sorte de PCR à faible stringence qui donne un profil particulier à chaque polymorphisme.

    Voilà l'abstract d'un article que j'ai trouvé là dessus:

    Polymerase chain reaction (PCR)-based DNA typing is routinely used in forensics for identity testing. Those assays that distinguish single nucleotide polymorphisms (SNPs) require other biochemical reactions in addition to PCR to identify the sequence polymorphisms. Low-stringency sequence-specific PCR (LSSP-PCR) is an example of a recent method that does not require additional biochemical treatments. The analysis of LSSP-PCR by capillary electrophoresis (CE) to discriminate the highly polymorphic mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop region is described. The DNA from five individuals were amplified (first step) using sequence-specific primers to produce 1021 bp fragments containing the D-loop region. Each fragment was isolated by electroelution using CE and UV detection, and subjected to a second amplification (second step) using a single primer annealed under low stringency conditions. This generated a range or profile of PCR products for each sample, which were resolved and analyzed by CE with the intercalator TOTO-1 and laser-induced fluorescence (LIF) detection. The LSSP-PCR profiles were unique for each individual, indicating that this technique may be applicable for forensic identity testing.

    Electrophoresis
    Volume 17, Issue 9 , Pages 1499 - 1504
    Published Online: 14 Apr 2005

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