Pourquoi E.coli n'évoluent-elles pas en d'autres types de bactéries qui ne sont pas E.coli?

[extrazlove]

Bonjour à tous à toutes,

Pourquoi les bactéries E.coli n'évoluent-elles pas en d'autres types de bactéries qui ne sont pas E.coli malgré l'accélération de leur évolution en boîte de pétri ?

"L’équipe dirigée par Dominique Schneider au sein du LAPM [1] a utilisé la plus longue expérience d’évolution en cours dans le monde pour appréhender cette question. Dans le cadre de ce projet, des populations bactériennes ont été initiées à partir d'une cellule unique d'Escherichia coli (« l'ancêtre ») et sont cultivées nuit et jour, 365 jours par an, depuis 1988. Les chercheurs effectuent des prélèvements à intervalles réguliers sur ces populations, et les conservent, ce qui permet d'obtenir de véritables archives fossiles vivantes et d'analyser leur évolution. Au cours de cette longue expérience qui représente aujourd'hui plus de 55 000 générations (ce qui, à l'échelle humaine, correspond à près de deux millions d'années), les chercheurs ont identifié une population de bactéries qui a vu sa capacité à produire des mutations augmenter de plus de 100 fois, constituant ce que les généticiens appellent une population hypermutatrice, avant de constater que cette capacité continuait à évoluer…

En pratique, les chercheurs ont séquencé l’intégralité du génome bactérien à différents temps au cours de l’évolution (171 clones bactériens au total, séquençage réalisé par le Génoscope). Les données de séquençage ont été intégrées à la plateforme MicroScope [2], développée au Génoscope, et comparées au génome de l’ancêtre. Après 20 000 générations, ils ont observé une augmentation très importante du nombre de mutations, la population étant devenue hypermutatrice. En effet, d’une moyenne d’environ 40 à 50 mutations par génome à 20 000 générations, les bactéries sont passées à une moyenne de plus de 700 mutations à 40 000 générations. Mais le plus étonnant est que cette évolution s’est produite en plusieurs étapes avec une augmentation massive du taux de mutation suivie d’une diminution de ce taux de mutation.


L’équipe de Dominique Schneider a pu décrypter les mécanismes moléculaires mis en jeu dans ce processus multi-étapes, en analysant la séquence des génomes entiers de ces bactéries. Au niveau évolutif, cette population bactérienne est passée successivement d’une étape où le taux de mutation était élevé, ce qui lui a permis de s’adapter à son environnement, à une étape où le taux de mutation a diminué mais est resté à un niveau intermédiaire, ce qui lui a permis de poursuivre son adaptation en conservant une probabilité plus élevée de « trouver » des mutations bénéfiques, tout en réduisant la proportion de mutations néfastes."

Source:
https://www.cea.fr/presse/Pages/actu...e-a-essai.aspx

Clairement on n'observe pas de changement de type de bactérie, et malgré ça on pense qu'on est tous issus d'une seule bactérie qui donne plusieurs types de bactéries et d'organismes multicellulaires même si on accélère l'évolution du bactérie d'une manière artificiel dans une boite de pétri.

bizarre qu'une évolution de E. Coli par des mutations aléatoire dans cette expérience qui es équivalente à l'échelle humaine à près de deux millions d'années donne toujours une bactérie E. Coli et les mutations baisse et se stabilise vers des mutations surtout bénéfiques ,on observe ca aussi chez l'évolution d'hominidés d'abord il y avait plusieurs hominidé puis l'évolution devient stable et il y a juste homo sapiens sapiens.

Si l'évolution ca marche comme E.coli, homo sapiens sapiens sera le dernier d'hominidés, et aujourd'hui on aura une baisse de mutations et juste des mutations bénéfiques pour plus d'un milliards d'années non?
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[MissJenny]

Pourquoi les bactéries E.coli n'évoluent-elles pas en d'autres types de bactéries qui ne sont pas E.coli malgré l'accélération de leur évolution en boîte de pétri ?

E coli évolue, comme tous les organismes vivants. Attention au fait que l'évolution expérimentale est très différente de ce qui se passe dans la nature.

bizarre qu'une évolution de E. Coli par des mutations aléatoire dans cette expérience qui es équivalente à l'échelle humaine à près de deux millions d'années donne toujours une bactérie E. Coli et les mutations baisse et se stabilise vers des mutations surtout bénéfiques ,on observe ca aussi chez l'évolution d'hominidés d'abord il y avait plusieurs hominidé puis l'évolution devient stable et il y a juste homo sapiens sapiens.

ça c'est totalement erroné. L'évolution ne se stabilise pas, ni pour E coli ni pour H sapiens.

[titijoy3]

l'évolution dépend peut être des conditions d'existence,

si E.coli se trouve bien comme elle est elle n'a peut être pas besoin de muter de façon fondamentale ?

ce sont des questions.. je n'y connais rien

[pm42]

si E.coli se trouve bien comme elle est elle n'a peut être pas besoin de muter de façon fondamentale ?

L'évolution ne se produit pas du tout comme ça : une bactérie ou tout organisme "ne se trouve pas bien ou pas bien" et il n'y a pas de "besoin de muter".
Des mutations se produisent aléatoirement et elles sont sélectionnées ou pas (en 1ère approximation).
Ta formulation suppose une forme de conscience collective d'une bactérie et une décision d'évoluer ou non. C'est difficile de faire plus faux.

ce sont des questions.. je n'y connais rien

En effet donc pourquoi répondre et surtout pour dire des choses qui induisent en erreur ?

[A voir en vidéo sur Futura]

[titijoy3]

je ne répond pas, je pose des questions,

ah oui, dans le post 3 j'ai oublié de mettre un point d'interrogation à la fin de la première phrase !

qu'est ce qui fait qu'une mutation aléatoire est retenue ou pas ?

[MissJenny]

qu'est ce qui fait qu'une mutation aléatoire est retenue ou pas ?

c'est une question qui a été longtemps débattue (et qui l'est encore parfois). Les deux points de vue sont dits "darwinien" : les mutations retenues sont celles qui sont bénéfiques, et "neutraliste" : c'est le hasard qui fait que telle mutation est retenue.

[extrazlove]

E coli évolue, comme tous les organismes vivants. Attention au fait que l'évolution expérimentale est très différente de ce qui se passe dans la nature.




ça c'est totalement erroné. L'évolution ne se stabilise pas, ni pour E coli ni pour H sapiens.

C'est quoi la différence entre une bactérie en boîte de pétri et une bactérie dans la nature ?
Selon cette expérience qui y a commencé depuis 1988 c'est ça qu'on observe d'abord une augmentation des mutations puis après une baisse de mutation et E. Coli même si elle mute elle reste une E. Coli.

[Deedee81]

Deux choses ::

- Sérieuse : une bactérie a le nom que NOUS lui donnons. Les bactéries après mutation s'appellent E.Coli parce que c'est NOUS qui les appelons ainsi.

- Moins :

C'est quoi la différence entre une bactérie en boîte de pétri et une bactérie dans la nature ?

La différence c'est que l'une est dans la une boite de Pétri et l'autre dans la nature

[extrazlove]

Deux choses ::

- Sérieuse : une bactérie a le nom que NOUS lui donnons. Les bactéries après mutation s'appellent E.Coli parce que c'est NOUS qui les appelons ainsi.

- Moins :



La différence c'est que l'une est dans la une boite de Pétri et l'autre dans la nature

Bah comme les races de chiens on peut appeler chaque race de chien par un nom diffèrent mais ca reste un chien ,il n'est pas autre chose qu'un chien
Comme ici si E.coli on l'appelle toujours E.coli car elle est toujours un E.coli pas autre chose
Je ne trouve aucun différence entre une bactérie dans la nature et une bactérie en boite de pétri, appart la nutrition en boite de pétri a gogo pour que la bactérie mute toujours

[MissJenny]

C'est quoi la différence entre une bactérie en boîte de pétri et une bactérie dans la nature ?

à peu près la même que celle entre un animal captif et un animal sauvage. Ils n'ont pas du tout la même espérance de vie, ni la même fécondité. L'évolution est beaucoup plus contrainte qu'on pourrait le penser. Une mutation peut se maintenir en boîte de Petri parce que les bacteries y sont choyées et être éliminée dans la nature parce qu'elle conduit à un désavantage compétitif avec les bactéries résidentes (sauvages).

[extrazlove]

à peu près la même que celle entre un animal captif et un animal sauvage. Ils n'ont pas du tout la même espérance de vie, ni la même fécondité. L'évolution est beaucoup plus contrainte qu'on pourrait le penser. Une mutation peut se maintenir en boîte de Petri parce que les bacteries y sont choyées et être éliminée dans la nature parce qu'elle conduit à un désavantage compétitif avec les bactéries résidentes (sauvages).

Est ce qu'il y a un lien entre l'évolution et la compétition?
L'évolution selon Darwin est un process totalement aléatoire et même si il n'y a pas une compétition normalement ce process va augmenter pas baisser comme dans cette expérience..

[Deedee81]

Est ce qu'il y a un lien entre l'évolution et la compétition?

Oui, à travers la sélection.

L'évolution selon Darwin est un process totalement aléatoire

Non, tu te trompes. A ta décharge c'est une erreur extrêmement commune (je l'ai vu plusieurs fois sur ce forum).

Ce sont les mutations qui sont aléatoires (bien que Darwin ne parlait pas de mutations, non connu, je crois à confirmer qu'il parlait de "caractères") pas l'évolution.

Et l'évolution c'est les mutations et la sélection
(avec une grande complexité dans cette dernière et d'autres aspects interviennent comme l'hérédité, les dérives génétiques, les mutations neutres, les régulations des gènes, quelques aspects épigénétiques, etc....)
Et la sélection n'a rien d'aléatoire.

Et la compétition est un des facteurs entrant dans la sélection (ce n'est pas le seul)

[MissJenny]

pour revenir à ton interrogation initiale, remarque que les bactéries sont beaucoup plus variables, à l'intérieur d'une même "espèce" que les humains. E coli par exemple a entre 4000 et 5000 gènes selon les souches. Cette variabilité est bien supérieure à celle qu'on observe chez les espèces de métazoaires par exemple. Donc en un sens on peut dire que le nom E coli recouvre plusieurs espèces.

[Flyingbike]

pour revenir à ton interrogation initiale, remarque que les bactéries sont beaucoup plus variables, à l'intérieur d'une même "espèce" que les humains. E coli par exemple a entre 4000 et 5000 gènes selon les souches. Cette variabilité est bien supérieure à celle qu'on observe chez les espèces de métazoaires par exemple. Donc en un sens on peut dire que le nom E coli recouvre plusieurs espèces.

Pour rebondir là dessus, en microbiologie (c'est aussi un peu le cas, dans une moindre mesure, avec les levures), la notion d'espèce est effectivement floue et variable (par exemple, une partie des Lactobacillus pourtant connus depuis des décennies a été remaniée et a donné une petite dizaine de nouveaux genres).
Pour illustrer le propos de MissJenny, chez l'espèce E. coli on trouve à la fois des pathogènes dangereux (Ex O157H7) et des probiotiques (Nissle 1917).

[extrazlove]

pour revenir à ton interrogation initiale, remarque que les bactéries sont beaucoup plus variables, à l'intérieur d'une même "espèce" que les humains. E coli par exemple a entre 4000 et 5000 gènes selon les souches. Cette variabilité est bien supérieure à celle qu'on observe chez les espèces de métazoaires par exemple. Donc en un sens on peut dire que le nom E coli recouvre plusieurs espèces.

L'évolution marche pour l'unicellulaire et multicellulaire, on peut dire aussi que les loups recouvre la totalité des races des chiens ,et a la place de dire race on peut bien dire espèce...