Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down" ?
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Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down" ?



  1. #1
    Geb

    Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down" ?


    ------

    Bonjour,

    J’ai regardé récemment une conférence relativement ancienne de Bill McClain à l’Université Yale, datée du 24 mars 2016 :

    William McClain - Origins of the Genetic Code and Transfer RNA Were Inextricably Linked (31 minutes)

    Le début du discours de Bill McClain vend un peu du rêve :

    Citation Envoyé par Bill McClain
    "Today, I’d like to talk about the origin of life on the planet Earth. And I hope to convince you the process is so simple, it’s probably gonna happen elsewhere in the Universe and beyond. Perhaps not generating human beings, but the mechanism by which the code arose is extremely simple. As we understand it, the RNA World generated molecules that became proteins, and […] protein molecules are the predominant determinants of an organism’s behavior, and shape, and function. And proteins arise from the genetic code and transfer RNA. And I was thinking about the two, and I think they’re inextricably linked. Neither the genetic code, nor the transfer RNA has any meaning, biochemical or genetic, without the other!"
    J’ai regardé la conférence une deuxième fois et pourtant, même s’il nous dit qu’il espère nous convaincre, au cours de sa conférence, que le processus ou le mécanisme par lequel le code génétique est apparu est "extrêmement simple", je ne pense pas avoir tout compris en quoi sa conférence démontre cela. Quelqu’un pourrait-il m’éclairer ?

    Maintenant, en adoptant une perspective plus large, qui fait davantage écho au titre de cette discussion… Si je me limite aux 25 dernières années, on a probablement aujourd’hui des centaines de conférences "grand public" et autres podcasts audio, sur YouTube ou ailleurs, qui tentent (avec plus ou moins de réussite) de vulgariser des expériences scientifiques dites "bottom-up" sur les origines de la vie sur la Terre.

    Quant à la recherche dite "top-down" dans le même domaine, je serais intéressé de savoir si d’autres parmi les membres de ce Forum font le même constat que moi, mais elle me paraît, et je le déplore, beaucoup moins souvent vulgarisée.

    Ci-après, je vous livre trois autres exemples de conférences que j’ai eu le plaisir de regarder ces derniers mois. Elles sont certes relativement anciennes, mais elles illustrent bien ce deuxième cas de figure :

    George Fox - Ribosome Origins and Evolution (37 minutes)

    Loren Williams - RNA and Protein: Molecules in Mutualism (74 minutes)

    Massimo Di Giulio - What is Evolution? (32 minutes)

    À ma connaissance, il y a quelques autres conférences de ce type, qui concernent souvent les spéculations à propos des origines de l’appareil cellulaire de traduction. Mais comme je le disais, elles sont relativement peu courantes.

    Dans la courte liste ci-dessus, les conférences de George Fox et Loren Williams sont à la fois fascinantes et tout à fait compréhensibles, même pour moi. Ce sont les deux autres conférences (en particulier celle de Bill McClain citées en première) qui ont motivé la création de cette discussion.

    L’exemple de Massimo Di Giulio est assez dramatique, parce que, malgré une production scientifique absolument impressionnante, et les débats épiques (un plaisir à lire !) qu’il a pu mener avec des collègues présentant des hypothèses concurrentes aux siennes, son accent italien très prononcé en anglais le déssert complètement dans cette conférence.

    Cordialement.

    -----

  2. #2
    Geb

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    Bonsoir,

    J'en suis venu à la conclusion que la seule manière pour moi de comprendre le propos de Bill McClain, c'était de retranscrire mot-à-mot sa conférence et d'essayer de me procurer toutes les publications qu'il cite.

    Malgré tout, il y a deux instants (marqués par [???]) au cours desquels je ne comprends tout simplement pas ce qu'il dit à partir de 12'27'' dans la vidéo :

    Citation Envoyé par Bill McClain
    "We knew right away, the minute we saw a G-U, we knew Francis's structure, we also know that [???] show that A-C was isosteric with G-U, in that the A is pushed into the minor groove and the U [is pushed] into the major groove. She was studying DNA. She was interested in [???]."
    Quelqu'un avec de meilleures oreilles que moi serait-il susceptible de me venir en aide à propos de ce passage en particulier ?

    Cordialement.

  3. #3
    Flyingbike
    Responsable des forums

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    En premier j’entends «*oh canard*», ce que confirme le sous titrage automatique

    En second on comprend in vivo Genesis mais ça n’a pas beaucoup de sens…
    La vie trouve toujours un chemin

  4. #4
    Geb

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    Salut Flyingbike,

    Citation Envoyé par Flyingbike Voir le message
    En premier j’entends «*oh canard*», ce que confirme le sous titrage automatique

    En second on comprend in vivo Genesis mais ça n’a pas beaucoup de sens…
    Pour le premier, j'ai d'abord pensé à un instrument de mesure (ou une technique spécifique qu'il aurait utilisé), mais ensuite, il dit de cette supposée "O. Canard" qu'il s'agit d'une femme et qu'elle était intéressée par quelque chose que j'ignore. Pour le deuxième, j'ai aussi pensé à "laevo-genesis", mais ça n'a pas plus de sens non plus...

    Aussi, dans mon petit passage j'ignore si c'est "groove" ou "grove", mais c'est moins problématique.

    D'autres idées ?

    Cordialement.
    Dernière modification par Geb ; 30/04/2025 à 20h11.

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    Flyingbike
    Responsable des forums

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    je pense que le "canard" c'est effectivement un nom, mais je n'ai rien trouvé" de ressemblant en faisant la biblio autour du fait que A-C et G-U sont isostériques.

    Pour le genesis, c'est 99% sur, mais le truc a moitié mangé avant, je ne sais pas.
    Laevo genesis, dans le sens lévogyre ? en biochimie ça peut avoir du sens.



    Enfin, c'est groove, en référence aux minor et major groove de la structure hélicoïdale des acides nucléiques (nommé sillon en français)
    La vie trouve toujours un chemin

  7. #6
    JPL
    Responsable des forums

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    Malheureusement mes oreilles, même équipées d’électronique ne sont d’aucun secours. Donc juste une idée foireuse : ce ne pourrait pas être O’Connor ou quelque chose comme ça ?
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  8. #7
    Topopa

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    Olga Kennard ?

    Mais pour le genesis, aucune idée

  9. #8
    Flyingbike
    Responsable des forums

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    Citation Envoyé par Topopa Voir le message
    Olga Kennard ?

    Mais pour le genesis, aucune idée
    ça colle pas mal:
    La vie trouve toujours un chemin

  10. #9
    Topopa

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    Ça peut être de ces travaux qu'il parle non ? J'ai plus de connaissances en recherche Google qu'en biomol honnêtement, donc je vous laisse juger de la pertinence (ou non)

    Brown T, Kennard O, Kneale G, Rabinovich D. High-resolution structure of a DNA helix containing mismatched base pairs. Nature. 1985 Jun 13-19;315(6020):604-6. doi: 10.1038/315604a0. PMID: 4010774.

  11. #10
    Geb

    Re : Origines de la vie : les expériences "bottom-up" sont-elles mieux vulgarisées que les "top-down

    Bonjour,

    Citation Envoyé par Topopa Voir le message
    Olga Kennard ?
    Merci Topopa. Il s’agit clairement d’Olga Kennard.

    Citation Envoyé par Topopa Voir le message
    Ça peut être de ces travaux qu'il parle non ? J'ai plus de connaissances en recherche Google qu'en biomol honnêtement, donc je vous laisse juger de la pertinence (ou non)
    Brown T, Kennard O, Kneale G, Rabinovich D. High-resolution structure of a DNA helix containing mismatched base pairs. Nature. 1985 Jun 13-19;315(6020):604-6. doi: 10.1038/315604a0. PMID: 4010774.
    Si on en croit Google scholar, Kennard est citée dans 4 publications pour lesquelles Bill McClain est soit auteur, soit co-auteur (McClain, 1993 ; McClain et al., 1987, 1988, 1993).
    Seule la première est disponible à la lecture, et dans celle-ci, voilà je pense la seule publication d’Olga Kennard qui est citée :

    - Kennard, Olga (1985). "Structural studies of DNA fragments: the G·T wobble pair in A, B, and Z DNA; the G·A base-pair in B-DNA", Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, Volume 3, Issue 2 (August 1985), pages 205-226.

    Cordialement.

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