bonjour,je n'arrive pas à calculer la charge d'u polypeptide,vous avez une méthode pour calculer la charge nette d'un polypeptide à un ph donné,
j'ai l'exemple suivant:Pro-Asp-Lys à ph=2.
pouvez vous me donner des liens internet des exos pour calculer les charges nettes des polypeptides.
merci beaucoup.
Salut,
Suffit de connaitre les Pka des résidus de chaque acide aminé.
Ajoute à celà les extrémités -COOH et -NH3(+).
pKa (-cooh) de la proline: 2
pK(R) de Asp 3.9
pK(R) de lys 10.54
pK(-NH2) de lys 9.06
La proline n'a pas de chaine acidobasique.
A toi ensuite de déterminer à Ph = 2.0 la charge de chacune de ces fonctions acide/bases...et de faire la somme.
Re,
Voila le lien d'un tableau des acides aminés (au cas oû tu n'en aurais pas un devant toi)
http://www.123bio.net/pensebete/aa.html
Sinon, la seule formule dont tu aies besoin.
Ph = pka + log ([base]/[acide]), qui te permettra de déterminer à un ph donné la proportion de forme acide et base du résidus considéré.
Bon, tu peux aussi considérer que si tu as une différence de 2 unités de ph, alors, une seule forme existe.
Pas la peine de calculs inutiles.
En espérant t'aider, Morphine.
Ca me rappel les exos que je faisais en médecine PCEM1 en enseignements dirigés. Pas que de bons moments ^^
J'aurai eu tendance comme morphine à me baser sur le PKa de l'acide aminé pour un pH acide =)
