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Modèle Moléculaire



  1. #1
    Butter-Scotch-Tape

    Modèle Moléculaire

    Bonjours à tous!
    Je voudrais savoir si vous utilisez des programmes visualisation moléculaire (Rasmol, p.d.b., ect...) ou juste par dessin ou par formule...

    Merci de votre vote !

    J-P!

    -----


  2. Publicité
  3. #2
    ArtAttack

    Re : Modèle Moléculaire

    En cristallo, on ne peut pas travailler avec des dessins dés qu'on dépasse les simples fcc NaCl like.
    Des logiciels permettent de dessiner des structure, d'en déduire des diffracto théoriques, et de bien positionner les atomes (subst, insertion et tout ...)
    D'autres programmes permettent de procéder à l'affinement Rietveld des XRD. On voit alors les taux d'occupation des atomes ainsi que les paramètres de maille au 1/10000 d'angstrom prés.

    Ce n'est que pour mon cas.
    Mais de nos jours, l'informatique est un outil indispensable en chimie.

  4. #3
    henrydes

    Re : Modèle Moléculaire

    ca serait sympa de nommer ce, ou ces logiciels...

  5. #4
    Jackyzgood

    Re : Modèle Moléculaire

    Quel est l'interet de donner le parametre de maille a 1/10000 d'angstrom prés sachant qu'au dela du 0 K l'agitation thermique agitera la maille et que de plus les instruments de mesures n'ont accès a une tel definition.

  6. #5
    ArtAttack

    Re : Modèle Moléculaire

    Aucun instrument de mesure ne donne le paramètre de maille.
    Seul un DRX permet cette déduction.

    L'agitement thermiques est pris en compte dans l'affinement Rietveld.
    Exemple :
    - Acquisition d'un diffractogramme par pas de 0,02° avec 30s de comptage pour chaque point (cela dure une bonne journée)
    - Utilisation de Fullprof
    - Entrée des paramètres de maille calculés grossièrement et des centrages des atomes
    - Définition de l'amplitude du bruit et du shift
    - Le programme calcule alors par itération chaque paramètre (dont le facteur Gaussien/Lorentzien des pics, les positions précises, les paramètres précis, les taux d'occupation, le facteur thermique, ...)

    Pour cela, il se base sur un paramètre à la fois et essaye d'obtenir la différence des carrés des DRX pratiques et théoriques nulle.
    Bien sûr il faut un peu de bon sens.
    Par exemple, si d'aprés les tables cristallo, un atome est centré en (x,y,1), le 1 ne pourra être 1,000...1
    De même on ne pourra pas jouer ET sur le taux d'occupation ET sur la position d'un même élément.

    Pour finir, un paramètre de maille aussi précis est plus important que tu sembles imaginer.

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Jackyzgood

    Re : Modèle Moléculaire

    Citation Envoyé par ArtAttack
    ....Pour finir, un paramètre de maille aussi précis est plus important que tu sembles imaginer.
    C'est la question que je me pose !! pourquoi est-ce aussi important ?

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