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calcul PHi d'un peptide



  1. #1
    SNODK

    Exclamation calcul PHi d'un peptide


    ------

    Bonjour à tous ,

    Je ne comprend pas bien comment fonctionne le calcul du phi d'un peptide : je connais la méthode où l'on prend le pkA des AA en Nt et en Ct puis on divise par 2 .

    A l'inverse je ne comprend pas comment s'effectue le calcul du PHi avec l'aide d'un tableau où l'on doit prendre en comte les pkA des AA en Nt et Ct ainsi que es pka des chaines latérales basiques et acides .
    Avec pour des Ph différents , sous quelles formes les groupements COOH et NH2 de chaque AA .

    Désolé de ne pas pourvoir illustrer ceci par un exmple , en fait c'est un peu comme un tableau de signe avec les pkA en haut(horizontal) et sur le coté(vertical) on a les différents AA ; et entre chaque pkA on a des signes + ou - et lorque que la charge globale est = 0 on prendre les pkA de cette intervalles puis on divise aussi par 2 ; cependant je ne comprend pas du tout comment se mettent les signes + et - .

    En espérant + de précisions de votre part ou bien une autre
    méthode

    Merci .

    -----

  2. #2
    jeanne08

    Re : calcul PHi d'un petide

    Je n'ai guère fait de biochimie mais je vais t'expliquer les domaines de prédominance ... cela va paeut être t'aider .
    On a toujours Ka qui est verifié donc pH = pKa + log (base)/(acide)
    Si pH = pka on a autant de forme acide que de forme basique ( frontière)
    Si pH<pka l'acide prédomine ( plus grande quantité) et ceci d'autant plus qu'on s'éloigne de la frontière
    Si pH > pKa on a la forme basique qui prédomine et ceci d'autant plus que l'on s'éloigne de la frontière

    Pour un acide amine NH2 -A- COOH de pK 2 et 9 on a donc
    pour pH<2 la forme +3HN -A- COOH qui prédomine (une charge + )
    pour pH allant de 2 à 9 la forme +3HN -A- COO- qui prédomine ( charge 0)
    pour pH > 9 la forme NH2 -A- COO- qui prédomine ( 1 charge -)

    La forme neutre prédomine entre pH 2 et 9 et sa concentration est maximale loin des 2 frontières donc vers pH (2+9)/2

    peut être que ces bases peuvent t'aider à comprendre ...

  3. #3
    vpharmaco

    Re : calcul PHi d'un petide

    J'avais essayé de donner une explication dans cette discussion http://forums.futura-sciences.com/ch...-bioch-p1.html

    en esperant que cela t'aidera a comprendre

  4. #4
    SNODK

    Re : calcul PHi d'un peptide

    Super !! merci bien vpharmaco d'avoir répondu à ma question sans le savoir

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