Sequence primaire d'un peptide ayant subi des hydrolyses.

[invitef08da5ad]

Bonjour à tous,

Un exercice m'est donné mais je ne sais pas vraiment comment m'y prendre, voilà l'énoncé

"L'hydrolyse acide totale d'un peptide donne Arg, Val, Tyr, Glu, Lys, Ala, Gly
L'hydrolyse par la trypsine libère Arg (Ala, Lys) et (Glu, Tyr, Gly, Val)
L'hydrolyse par la carboxypeptidase A donne Gly
L'hydrolyse par la chymotrypsine donne (Glu, Gly) et (Lys, Val, Ala, Tyr, Arg)

Pouvez vous donner la séquence primaire du peptide ?*»


Alors évidemment je connais les différentes propriétés des différents enzymes, mais même avec cela je bloque et ne sais par où commencer…


Pouvez vous m’aider ?
Merci beaucoup !
-----

[invite8ec823ef]

Salut !

Je n'y connais pas grand chose, mais je pense qu'il faut y aller avec cette logique :
L'hydrolyse par la carboxypeptidase donne Gly. Elle coupe à partir d'une extrémité. Donc ta chaîne commence ou finit par Gly.

Après, tu vois que la chymotrypsine donne (Glu,Gly). Tu as donc l'ordre des deux premiers ou deux derniers AA. Elle coupe en aval d'un Tyr, Trp, Phe ou Leu.
Donc le troisième AA est Tyr.

La trypsine donne (Glu, Tyr, Gly, Val). Tu as déjà les trois premiers. Tu déduis que ton quatrième AA est Val.
D'après Wikipedia, "La trypsine est une endoprotéase qui hydrolyse les liaisons peptidiques dans lesquelles un acide aminé basique (Lys-|-Xaa ou Arg-|-Xaa) engage sa fonction acide"
Tu vois que dans les deux AA restant, tu as Lys, qui est basique. La trypsine interagit avec.

Donc en final, tu trouves : COOH-Gly-Glu-Tyr-Val-Lys-Ala-NH3

Je ne m'y connais pas très bien, donc tu vérifieras si je n'ai pas dit de trop grosse boulette ^^

@+

[invitef08da5ad]

Bonjour,

Je te dirai demain si c’est juste mais en tous cas, ça semble coller avec les propriétés des enzymes

Merci beaucoup

[HarleyApril]

Bonsoir

La carboxypeptidase coupe au niveau du carboxy terminal. Le peptide se termine donc par Gly.

cordialement

[A voir en vidéo sur Futura]