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données liaisons hydrogène et stacking



  1. #1
    nabotdechimie

    données liaisons hydrogène et stacking


    ------

    bonjour à toutes et tous.

    Je suis en train de chercher une corrélation entre la perte d'affinité d'une enzyme pour son substrat due à une mutation et la perte d'interactions due à cette même mutation.

    Par exemple, si la mutation d'une Phe en Ala provoque une perte d'affinité de 1000 fois, je veux être capable de déterminer si la Phe était impliquée dans un stacking, ou juste dans des liaisons hydrophobes.

    Pour cela, je suis à la recherche de données concernant les valeurs énergétiques d'une interaction hydrophobe, d'un pont hydrogène, d'un stacking (classique et T-shape) en fonction de la distance et de l'angle entre les fonctions impliquées.

    toutes les réponses et remarques sont les bienvenues.

    Merci d'avance pour votre aide.

    -----
    Aucune question n'est idiote, seules les réponses peuvent l'être. N'hésitez pas ;-)

  2. #2
    Lulu67in21

    Re : données liaisons hydrogène et stacking

    Bonjour,

    Une piste potentielle :
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/q...=pubmed_DocSum

    Il s'agit d'une excellente review passant en revue l'ensemble des interactions de type stacking recensées dans la nature.

    J'espère que ca pourra vous aider un peu,

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