Protéines

[invite03faafbf]

Bonjour,
Je m’intéresse à la biochimie, mais j'ai quelques soucis avec des notions qui me dépassent un peu pour l'instant.
Je vous remercie d'avance pour votre aide et vos explications.

Question 1:
Quelle est la charge des peptides à pH =7,5?
Gly-Asp-Arg
Trp-Trp-Ile-Val-Glu-Pro-Thr-Pro-Arg
Tyr-Ser-Leu-Glu-Asp-Lys
Glu-Gly-Cys-Ser-Thr-Phe-Lys
His-Val

Question 2: Lequel des peptides cités ci-dessus est le plus hydrophobe?

Question 3: Protéine A (pI=4,5) et protéine B (pI=9,5). Pourquoi existe-il une différence du pI entre les deux protéines? Est-ce que c'est la composition en acides aminés basiques et acides ou c'est due à autre chose?
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[HarleyApril]

Bonsoir

Il faut que tu comprennes que les acides aminés, au sein des peptides, vont avoir une charge selon la nature de leur chaîne.

Ainsi, l'acide aspartique et l'acide glutamique portent une fonction carboxylique sur leur chaîne latérale. A pH physiologique, cette fonction est sous forme de carboxylate. On a donc une charge négative.

Les acides aminés basiques porteront une charge positive.

Il te faut donc identifier les acides aminés acides et basiques dans tes peptides pour en calculer la charge.



L'hydrophobie va être due à la présence d'acides aminés dont la chaîne latérale est hydrophobe. Là aussi, il faut faire l'inventaire.


Le PI dépend de la composition en acides aminés basiques et acides.


Cordialement