Extraction total RNA from formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) tissue

[EC2M3]

Bonjour à tous
Nous sommes actuellement en possession d'échantillons de tissus fixés à la paraffine (FFPE) dans notre laboratoire et nous souhaitons extraire leur ARN. Nous aimerions savoir quel kit serait le mieux adapté à cette tâche. Est-ce que le kit RNeasy DSP FFPE de Qiagen convient pour cette application ? Est-ce que quelqu'un aurait de l'expérience avec ce kit et pourrait nous fournir des conseils ou des recommandations ?

Nous vous remercions sincèrement pour votre aide.

Cordialement,
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[Flyingbike]

Bonsoir

C’est un peu particulier comme extraction. J’ai extrait de l’ADN de tissus FFPE mais pas d’ARN.

Néanmoins, à votre place et en absence de feed-back, je me fierais a l’efficacité des kits qiagen qui ont très bonne réputation (et jusque là confirmé par mon expérience et celle de mes collègues)

Le protocole devrait contenir toutes les indications utiles, matériel de départ, rendement, etc. À lire en entier (même le «*troubleshooting*» avant toute opération)

[EC2M3]

Bonsoir
Merci pour votre réponse.
Nous avons également effectué l'extraction de l'ADN avec les kits Qiagen et nous en sommes satisfaits. Cependant, pour l'extraction de l'ARN, j'aimerais bénéficier des expériences des autres pour déterminer si ce kit convient ou s'il est nécessaire de préparer un autre kit.

Bien à vous

[Flyingbike]

Re
Je doute que vous ayez des retours ici
Et s’il existe des alternatives, ce qui est sûr, je doute que ce soit radicalement différent d’un kit qiagen, sur la méthode comme sur les performances.

Vous aurez probablement des réponses en posant votre question sur ResearchGate (en anglais bien sur)

[A voir en vidéo sur Futura]

[Liet Kynes]

Pourquoi ne pas demander directement au fabricant du kit envisagé ?

[Flyingbike]

Ah ben c’est sur qu’ils ne vont pas dire que leur kit est moins bon que la concurrence

[Liet Kynes]

Bof des fois, ils sont honnêtes mais faut tourner la demande de façon stratégique