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[Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN



  1. #1
    NathanEB

    [Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN

    Bonjour tout le monde,

    J'ai une petite question concernant la traduction de l'ARN :
    Il est apparemment possible dans une séquence codante d'identifier le domaine extra-cellulaire, intra et transmembranaire de la future protéine.

    Quelqu'un pourrait m'expliquer comment procéder ?

    Merci d'avance.

    -----


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  3. #2
    Flyingbike

    Re : [Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN

    un exemple très simple = si dans la séquence prédite il y a des domaines entiers plutot hydrophobes, il y a des chances que cette partie soit transmembranaire. Ensuite on peut aller plus loin en regardant la présence de peptide signal, ou encore par analogie avec des protéines existantes, etc.

  4. #3
    NathanEB

    Re : [Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN

    Super j'y avais pas pensé du tout.
    Et pour différencier intra et extra cellulaire je fais comment ?
    Et par rapport au peptide signal, il est souligné dans la séquence. Il m'apporte quoi comme information ?

  5. #4
    Flyingbike

    Re : [Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN


  6. #5
    NathanEB

    Re : [Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN

    Si je fais une synthèse de l'article j'obtiens :
    - la partie hydrophobe est membranaire
    - la partie la plus positive (ie avec le plus d'acides aminés basiques) est intra-cellulaire SAUF si le peptite signal est très hydrophobe.

    Je suis dans le vrai ou pas du tout ?

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Flyingbike

    Re : [Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN

    c'est l'idée MAIS la théorie ne se vérifie pas toujours. Ainsi la présence d'un domaine hydrophobe peut très bien correspondre à un domaine profond dans une protéine soluble et n'a rien a voir avec un domaine transmembrannaire.

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  10. #7
    NathanEB

    Re : [Biomol] Identifier les domaines cellulaires dans l'ARN

    D'accord, merci !

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