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Manque de mémoire sous R



  1. #1
    dothy82

    Manque de mémoire sous R


    ------

    Bonjour,

    je travaille actuellement avec un gros fichier de données dans R (5735 patients).
    Je veux faire un imputation multiple sur 9 variables car pour 18% des patients les données sont manquantes.
    J'utilise la library (mice) mais R me met le message d'erreur suivant:

    Erreur : impossible d'allouer un vecteur de taille 68681 Ko
    De plus : Warning messages:
    1: Reached total allocation of 509Mb: see help(memory.size)
    2: Reached total allocation of 509Mb: see help(memory.size)

    Quelqu'un sait-il comment remédier à cela? Est-ce-possible d'allouer plus de mémoire à R? Quelle autre alternative pouvez-vous me proposer?

    Merci par avance pour votre aide

    Cordialement,

    Dorothée

    -----

  2. #2
    kinette

    Re : Manque de mémoire sous R

    Bonjour,
    J'ai aussi rencontré ce problème, et il y a une commande qui permet d'augmenter cette mémoire, si c'est celle du workspace il faut rajouter workspace = 200000 entre deux virgules dans la ligne de commande (le 200000 peut être augmenté ou diminué en fonction des demandes).
    Bon courage,
    K
    Nomina si nescis, perit et cognito rerum.

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