Détection de contour sur Image J
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Détection de contour sur Image J



  1. #1
    Kanagal

    Détection de contour sur Image J


    ------

    Bonjour,
    Après une première discussion, je cherche dans un premier temps à chercher le contour des fibres, puis dans un second temps celui du fluide pour ensuite appliquer un Image Calculator pour superposer les deux images.

    On m'a parlé de Analyze particle, mais je n'arrive pas à l'utiliser, je n'arrive pas à obtenir des éléments sur chaque fibre

    -----
    Images attachées Images attachées  

  2. #2
    Kanagal

    Re : Détection de contour sur Image J

    Y a t'il un autre moyen pour obtenir juste le contour des fibres ?

  3. #3
    umfred

    Re : Détection de contour sur Image J

    tu as regardé l'exemple donné sur Image J https://imagej.nih.gov/ij/docs/pdfs/examples.pdf

  4. #4
    Flyingbike
    Modérateur*

    Re : Détection de contour sur Image J

    une image plus grande serait assez utile pour améliorer la mise au point de la détection
    La vie trouve toujours un chemin

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    Kanagal

    Re : Détection de contour sur Image J

    Je vous ai mis l'image taille réelle
    Images attachées Images attachées  

  7. #6
    Flyingbike
    Modérateur*

    Re : Détection de contour sur Image J

    Si vous faites

    image en 8 bits
    find edges
    threshold
    watershed
    analyse particles (size 6000-infinity; circularity 0.8-1)

    vous obtenez sur cet exemple 13 ROI






    on doit pouvoir seuiller pour détecter le fluide
    Images attachées Images attachées  
    La vie trouve toujours un chemin

  8. #7
    Kanagal

    Re : Détection de contour sur Image J

    Super merci, mais pour vous êtes en quel "unité" lors de l'analyse particle ? Pixel ou Inch^2?

  9. #8
    Flyingbike
    Modérateur*

    Re : Détection de contour sur Image J

    en pixel² car je n'ai pas les métadonnées de correspondance de taille.


    Le problème de votre image est qu'il y a un artefact de diffraction en haut à gauche et ça demande un peu de "manuel" pour rectifier la détection.


    Une fois les régions identifiées, que devez vous en faire ?
    La vie trouve toujours un chemin

  10. #9
    Kanagal

    Re : Détection de contour sur Image J

    j'ai un stack de 2016 slice. Ma tutrice de projet me demande de mesurer les déformations des fibres lors de l'imprégnation du fluide, trouver l'angle de contact, le taux de porosité, absorption du fluide par les fibres. Et je dois comparer pour deux matériau de fibre différent le lin et le PVDF.
    Ca peut paraitre facile, mais je n'avais jamais touché à ImageJ avant ce projet. Du coup j'essaye d'apprendre comme je peux sur internet

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