détermination de structures
bonjour!!!!
en cristallographie, j'ai appris comment on déterminait la structures de cristaux par diffraction des rayons X.
seulement cette méthode s'applique à des petites structures.
je voudrais savoir comment on détermine la structures de molécules qui ne sont pas des cristaux et sont de grandes taille, par ex les proteines;
J'ai commencé à me renseigner mais je n'y vois pas tres clair!
Merci pour vos infos
Bonjour,
Je ne sais pas comment les petites molécules sont observée d'ordinaire, mais il est désormais possible (depuis peu) de les observer par diffraction des rayons X ultra-courts ; voir notamment cet article.
tres interessant cet article. merci.
il m'amene cependant à poser une autre question.
quels types de rayonnement sont produit par un synchrotron?
BonjourEnvoyé par eredwen
bonjour!!!!
en cristallographie, j'ai appris comment on déterminait la structures de cristaux par diffraction des rayons X.
seulement cette méthode s'applique à des petites structures.
je voudrais savoir comment on détermine la structures de molécules qui ne sont pas des cristaux et sont de grandes taille, par ex les proteines;
J'ai commencé à me renseigner mais je n'y vois pas tres clair!
Merci pour vos infos
ça fait longtemps que l'on détermine les structures des protéines par DRX (quand on arrive a faire cristalliser ces protéines...)
Autrement il y a la RMN (résonance magnétique nucléaire)
cordialement
merci pour ces infos
mais la determination par DRX n'elle -t-elle pas confrontée à des problemes pour les structures de grandes tailles?
je pense par là au problème de phase
Des rayonnements synchrotron
En gros, ce sont principalement des rayons X, émis par des électrons accélérés (=prenant un virage, ou faisant des zig-zag dans un wiggler, etc.). Ces rayons X sont de caractéristiques diverses (longueur d'onde, durée du pulse, intensité...) selon l'appareillage employé et la torture que subissent les électrons.
d'accord
mais l'utilisation des RX produits par un synchrotron n'est-elle pas elle aussi soumise au probleme de phase?
comment faire pour résoudre ce probleme alors?
Bien évidemment, le problème de la phase existe également pour le rayonnement synchrotron.
Plusieurs méthodes existent pour surmonter ce problème : méthode de l'atome lourd, méthodes directes, methode MAD (Multi-wavelenght Anomalous Diffraction) surtout utilisée pour la résolution des molécules géantes.
Re : détermination de structures
Pour déterminer la structure de macromolécules à partir du rayonnement synchrotron, peut-on utiliser une autre méthode que la diffraction rayons X?
Alala
ce sujet est bien compliqué! j'ai beau chercher sur le net (je n'ai pas de bibliotheque à ma disposition) je n'arrive pas à repondre a cette question
peut etre l'absorption des rayons X?
merci de m'avoir aidé
j'y retourne
Ben pour ma part, à part les diffracter je ne vois pas trop ce qu'on pourrait faire avec un rayonnement synchrotron... Je veux bien admettre que je ne suis pas spécialiste, mais là je doute qu'il existe autre chose.
On peut également faire de l'exafs avec les X et en tirer des informations structurales. Mais bon, ça ne vaut pas la diffraction...
Un moyen très efficace pour déterminer les structures géométriques des molécules sont les études du spectre électronique, du spectre vibrationnel, des proprétés magnétiques etc...bonjour!!!!
en cristallographie, j'ai appris comment on déterminait la structures de cristaux par diffraction des rayons X.
seulement cette méthode s'applique à des petites structures.
je voudrais savoir comment on détermine la structures de molécules qui ne sont pas des cristaux et sont de grandes taille, par ex les proteines;
J'ai commencé à me renseigner mais je n'y vois pas tres clair!
Merci pour vos infos
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la philosophie générale est que le groupe de symétrie de la molécule a des influences qualitatives sur les propriétés évoquées ci-dessus. La symétrie géométrique engendre de la dégénerescence des états propres.
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Ce qui permet de passer des propriétés observables a la structure de la molécule se fait pas la médiation de la théorie de représentations des groupes.
coucou
oui en effet j'ai vu pas mal de choses sur la spectrométrie d'absorption des Rayons X.
Etes -vous sur que cette méthode ne permet pas de déterminer la structures de macromolécules?
Sinon, quelle informations donne l'EXAFS?
Non, non, aucune info sur les macromolécules, L'exafs ne donne que des renseignements sur les voisins de l'atome qui absorbe les X (généralement un atome lourd si mes souvenirs sont bon)... On utilise cette méthode quand on ne peut obtenir de cristaux. Regarde sur le web, je ne suis pas spécialiste de la question...
Cordialement
merci de pour cette réponse rapide.
l'exafs ne peut permettre de connaitre la structure d'une macromolécules.
C'est dommage car toute les biomolécules ne peuvent pas etre cristallisées.
je vais continuer à chercher sur le net.
merci
Je ne connais que deux méthodes pour les macromolécules : la cristallo et la RMN (la RMN pouvant être couplée avec la modélisation moléculaire).
c'est également ce que je pense (ce que j'ai trouvé du moins).
je trouve pourtant cela un peu juste.
je m'interesse en particulier au rayonnement synchrotron. je vais donc me focalisé sur la diffraction.
merci pour cette aide.
( bizarre j'étais persuadée que la détermination des structures de macromolécules grace au rayonnnemnt synchrotron pouvait se faire autrement que par diffraction)
vive la physique, si complexe soit-elle!
