Quel Livre pour initier un Biologiste à la programmation ?

[invitea87a57fa]

Bonjour à tous !

Voilà je me présente, je suis étudiant en 3ème année de licence Bio cellulaire et physiologie.

J'aimerais que quelqu'un ou quelques uns essaient de me renseigner sur divers livres pour démarrer mon initiation à tous ou du moins les principaux domaines informatiques que l'on retrouve dans une formation de bio-informatique par exemple :

Bases d'algorithmique et de programmation en langage C : notions d'algorithme, de fonction, de procédure ; variables et affectation ; passage de paramètres ; types de données simples et composés (tableaux, structures) ; récursivité ; algorithmes de tri ; allocation dynamique de mémoire ; pointeurs et listes chaînées.

Conception et utilisation des bases de données : principes de conception ; langages de requêtes ; les bases de données en Biologie et en génomique.

Voila j'espère que vous pourrez m'aider

Bonne journée !
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[Jack]

Bonjour,

les bases de l'algorithmique et de la programmation sont générales. L'info appliquée à la bio, la méca, le réseau, la gestion, ça vient après. Je pense donc que tout cours d'initiation doit convenir.
Tu devrais pouvoir trouver ton bonheur au niveau tutoriels sur le site du zéro.

A+

[invite765732342432]

Pour un non-informaticien, attaquer le C me semble une erreur.
Est-ce que c'est un langage imposé par ton cursus ?

Sinon, pour mon info, qu'elle est l'utilisation de l'informatique pour un biologiste ? Avez vous besoin de programmes rapides et performants à usage spécifique (genre pour plier/déplier une protéine) ou est-ce plutôt de la manipulation de données (auquel cas, il y a des éditeurs de programme graphiques qui peuvent être beaucoup plus adaptés) ?

[invitea87a57fa]

Alors oui le langage C est imposé par mon cursus dans plusieurs masters. En vérité le but du master 1 est de nous former à la programmation de base, avec utilisation du logiciel R, la programmation impérative (notamment avec l'utilisation du logiciel C) ou alors de la mise en place de base de données liée à la médecine ou au domaine de la biologie.
Voila en gros.

Pour Faith, je t'invite à aller sur les site de masters de Bio-Informatique ou l'explication de l'outil informatique dans la biologie te sera mieux présentée !

Dans un master ,on va utilisé ce bouquin apparemment :

«Le Langage C», B.W. Kernighan et D.M. Ritchie, MASSON

Le connaissez vous ?

[A voir en vidéo sur Futura]

[Jack]

Dans un master ,on va utilisé ce bouquin apparemment :

«Le Langage C», B.W. Kernighan et D.M. Ritchie, MASSON

Le connaissez vous ?

C'est communément appelé la bible du langage C, écrit par les concepteurs du langage.
C'est un ouvrage de référence, pas un ouvrage didactique.

A+

[invitea87a57fa]

AH effectivement c'est sans doute fait pour les néophytes...
Bon en gros le site zéro est la meilleure solution. Existe t-il des livres généraux qui abordent de manière générale ?

Par exemple ce livre, le connaissez vous ?

Bio-informatique - Principes d'utilisation des outils [Broché]
Jean-Loup Risler (Auteur), Denis Tagu (Auteur)

[Jack]

AH effectivement c'est sans doute fait pour les néophytes...

Au contraire, je le conseillerais plutôt à ceux qui veulent approfondir leurs connaissances.

Pour l'info consacrée à ta spécialité, je ne suis malheureusement pas compétent.

A+