Composition d'un peptide
je suis en train de préparer un concours et je me prends la tête sur un problème que je n'arrive pas à résoudre en consultant le web donc je m'adresse aux pro :
composition d'un peptide est P W K A 2L 2Y V 2S 2R T 2N Q H
quelle sa charge globale et son point isoélectrique
merci beaucoup pour vos réponses
Attention à utiliser des titres explicites,
Damon
Dernière modification par Damon ; 15/07/2004 à 18h38.
Hello
Pour sa composition:
Pro-Trp-Lys-Ala-Leu-Leu-Tyr-Tyr-Val-Ser-Ser-Arg-Arg-Thr-Asn-Gln-His
Tu peux vérifier mes dires:
http://www.infobiogen.fr/doc/data/tabaanuc.html
Charge globale et point isoélectrique: une fois ton tableau des charges posé, celà ne devrait pas te poser de problèmes.
Essaye ce lien, c'est un claculateur marrant:
http://www.infobiogen.fr/services/an...n/mwcalc_in.pl
Bon courage !
Re : Composition d'un peptide
Ouups j'ai "sauté" un Asn en fin de chaîne, pas vu que tu en avais mis deux
Pro-Trp-Lys-Ala-Leu-Leu-Tyr-Tyr-Val-Ser-Ser-Arg-Arg-Thr-Asn-Asn-Gln-His
En utilisant ce programme gratos en ligne on obtient ceci:
http://www.infobiogen.fr/services/a...in/mwcalc_in.plNOMBRE - (%) NOMB - POIDS - (%) POIDS
Leu L 2 - 11.11 - 226.17 - 10.13
Val V 1 - 5.56 - 99.07 - 4.44
Ser S 2 - 11.11 - 174.06 - 7.80
Pro P 1 - 5.56 - 97.05 - 4.35
Thr T 1 - 5.56 - 101.05 - 4.53
Ala A 1 - 5.56 - 71.04 - 3.18
Tyr Y 2 - 11.11 - 326.13 - 14.61
His H 1 - 5.56 - 137.06 - 6.14
Gln Q 1 - 5.56 - 128.06 - 5.74
Asn N 2 - 11.11 - 228.09 - 10.22
Lys K 1 - 5.56 - 128.09 - 5.74
Trp W 1 - 5.56 - 186.08 - 8.34
Arg R 2 - 11.11 - 312.20 - 13.99
Nombre de résidus = 18
Masse moléculaire (monoisotopique) = 2232.1550
Masse moléculaire (moyenne) = 2233.5173
Index de polarité (%) = 55.56
Point isoélectrique = 10.96
DO 260 (1mg/ml) = 2.218 DO 280 (1mg/ml) = 3.554
Composition atomique :
C = 101 N = 31 O = 27 H = 147 S = 0
Le mieux est de vérifier tout ça par toi même en refaisant l'exercice pour t'entraîner. Je n'ai pas eu le temps de vérifier ce programme.
@+
Guil'
Héhé, sa charge globale dépendra du pH!!
Ca c'était la question-piège!
Stéphane
Vi forcément
D'où l'utilité d'un tableau de charge du peptide
Guil'
sympa ce programme mais j'ai besoin d'arriver à calculer point isoélectrique et charge globale par mes propres moyens. Je sais que c'est un truc que j'ai appris en deug mais pas moyen de m'en souvenir.
j'ai trouvé la solution pour la charge nette steph avait raison car elle correspond à la somme des charges portées par chacun des radicaux ionisables des acides aminés dans une protéine à un ph donné.
pour calculer le phi il faut tracer un tableau des pk ionisable dans la protéine et leur attribué leur charge en fonction du pk des autre groupe . C'est pas clair comme ça mais il y a une bonne explication à page 9 de
http://www.scifa.univ-metz.fr/cours/...proprietes.pdf
merci pour vos réponses.
Hello
Content de voir que tu as trouvé les infos qui te manquaient !
Bon courage,
Guil'
