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Composition d'un peptide



  1. #1
    nadege

    Question Composition d'un peptide

    je suis en train de préparer un concours et je me prends la tête sur un problème que je n'arrive pas à résoudre en consultant le web donc je m'adresse aux pro :
    composition d'un peptide est P W K A 2L 2Y V 2S 2R T 2N Q H
    quelle sa charge globale et son point isoélectrique

    merci beaucoup pour vos réponses

    Attention à utiliser des titres explicites,
    Damon

    -----

    Dernière modification par Damon ; 15/07/2004 à 18h38.

  2. Publicité
  3. #2
    Guillmot

    Re : Composition d'un peptide

    Hello

    Pour sa composition:

    Pro-Trp-Lys-Ala-Leu-Leu-Tyr-Tyr-Val-Ser-Ser-Arg-Arg-Thr-Asn-Gln-His

    Tu peux vérifier mes dires:
    http://www.infobiogen.fr/doc/data/tabaanuc.html

    Charge globale et point isoélectrique: une fois ton tableau des charges posé, celà ne devrait pas te poser de problèmes.

    Essaye ce lien, c'est un claculateur marrant:
    http://www.infobiogen.fr/services/an...n/mwcalc_in.pl

    Bon courage !
    Compte à supprimer

  4. #3
    Guillmot

    Exclamation Re : Composition d'un peptide

    Ouups j'ai "sauté" un Asn en fin de chaîne, pas vu que tu en avais mis deux

    Pro-Trp-Lys-Ala-Leu-Leu-Tyr-Tyr-Val-Ser-Ser-Arg-Arg-Thr-Asn-Asn-Gln-His

    En utilisant ce programme gratos en ligne on obtient ceci:
    NOMBRE - (%) NOMB - POIDS - (%) POIDS

    Leu L 2 - 11.11 - 226.17 - 10.13
    Val V 1 - 5.56 - 99.07 - 4.44
    Ser S 2 - 11.11 - 174.06 - 7.80
    Pro P 1 - 5.56 - 97.05 - 4.35
    Thr T 1 - 5.56 - 101.05 - 4.53
    Ala A 1 - 5.56 - 71.04 - 3.18
    Tyr Y 2 - 11.11 - 326.13 - 14.61
    His H 1 - 5.56 - 137.06 - 6.14
    Gln Q 1 - 5.56 - 128.06 - 5.74
    Asn N 2 - 11.11 - 228.09 - 10.22
    Lys K 1 - 5.56 - 128.09 - 5.74
    Trp W 1 - 5.56 - 186.08 - 8.34
    Arg R 2 - 11.11 - 312.20 - 13.99

    Nombre de résidus = 18
    Masse moléculaire (monoisotopique) = 2232.1550
    Masse moléculaire (moyenne) = 2233.5173
    Index de polarité (%) = 55.56
    Point isoélectrique = 10.96
    DO 260 (1mg/ml) = 2.218 DO 280 (1mg/ml) = 3.554
    Composition atomique :
    C = 101 N = 31 O = 27 H = 147 S = 0
    http://www.infobiogen.fr/services/a...in/mwcalc_in.pl

    Le mieux est de vérifier tout ça par toi même en refaisant l'exercice pour t'entraîner. Je n'ai pas eu le temps de vérifier ce programme.

    @+
    Guil'
    Compte à supprimer

  5. #4
    Steph

    Re : Composition d'un peptide

    Héhé, sa charge globale dépendra du pH!!
    Ca c'était la question-piège!

    Stéphane

  6. #5
    Guillmot

    Re : Composition d'un peptide

    Vi forcément

    D'où l'utilité d'un tableau de charge du peptide

    Guil'
    Compte à supprimer

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    nadege

    Re : Composition d'un peptide

    sympa ce programme mais j'ai besoin d'arriver à calculer point isoélectrique et charge globale par mes propres moyens. Je sais que c'est un truc que j'ai appris en deug mais pas moyen de m'en souvenir.

  9. Publicité
  10. #7
    nadege

    Re : Composition d'un peptide

    j'ai trouvé la solution pour la charge nette steph avait raison car elle correspond à la somme des charges portées par chacun des radicaux ionisables des acides aminés dans une protéine à un ph donné.
    pour calculer le phi il faut tracer un tableau des pk ionisable dans la protéine et leur attribué leur charge en fonction du pk des autre groupe . C'est pas clair comme ça mais il y a une bonne explication à page 9 de
    http://www.scifa.univ-metz.fr/cours/...proprietes.pdf

    merci pour vos réponses.

  11. #8
    Guillmot

    Re : Composition d'un peptide

    Hello

    Content de voir que tu as trouvé les infos qui te manquaient !

    Bon courage,
    Guil'
    Compte à supprimer

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