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structure 3D à partir d'une séquence



  1. #1
    arthurette

    structure 3D à partir d'une séquence


    ------

    Bonjour à tous,

    Est ce que il existe un site qui serait capable à partir d'une sequence en acides aminés ou nucléotides de faire la structure en 3D de la protéine?
    J'ai déjà cherché sur ncbi et http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do mais mes recherches n'ont pas abouti
    En fait je cherche trés précisement la structure 3D du cytochrome B5 chez l'homme, il est référencé par P00167 chez ncbi.
    J'ai donc beaucoup d'information sur ce cytochrome mais j'aimerai le visualiser dans l'espace.

    Merci d'avance pour vos réponses.

    -----

  2. #2
    Yoyo

    Re : structure 3D à partir d'une sequence

    Salut

    il y a la bovine : http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1HKO
    qu'est-ce qui te fait penser que l'humaine n'a pas la meme structure?

    Pour l'humaine il y a des domaines visiblement disponibles :
    http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1MJ4
    et
    http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1UMK

    ca devrait etre largement suffisant pour voir a quoi ressemble la proteine en 3D non?

    Yoyo

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