salut,
y'a t-il quelqu'un qui pourrait m'aider à contruire un arbre phélogénétyque aprés une analyse à partir de la base de données NCBI format FASTA et BLAST
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26/12/2007, 00h07
#2
invite17a570c1
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Re : la bioinformatique
Salut,
un arbre phylogénétique peut être construit avec BioNumerics.
Sinon, étant donné que c'est un logiciel payant, essaie avec PHYLIP, PHYML ou fastDNAml 1.2. C'est mieux si tu as eu une petite formationa avant quand même, ce n'est pas vraiment très intuitif.
J'espère que ça aide.
Cordialement,
26/12/2007, 17h48
#3
invited7465f38
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Re : la bioinformatique
merci pour le coup de main !
26/12/2007, 18h18
#4
invite0aa1883c
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Re : la bioinformatique
Salut
Sur ton fichier de sortie de blast fait au ncbi au format HTML tu as une option "construct the distance tree" qui te permet d'avoir l'arbre. Je sais pas si le résultat est hyper fiable vu la méthode utilisée mais ca te donne un aperçu global de l'arbre sans se prendre la tête.
A+
J