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Bioinformatique



  1. #1
    teagol

    Bioinformatique

    Salut. Je remet cette partie de mon précédent topic en ligne car elle manquait de visibilté.

    Je suis intéressé par les masters en bioinformatique (je suis titulaire d'un PCEM et donc potentiellement d'une L2 en Sciences de la vie), mais il semble que les débouchés dans cette spécialité ne soient liés qu'à la génomique et post génomique, est-ce vraiment le cas? Les débouchés sont-ils importants dans cette filière? Dans quels secteurs? Et pour quel salaire?

    -----


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  3. #2
    desdemone

    Re : bioinformatique

    Bonjour,

    Les débouchés sont principalement dans le publique mais les postes sont rares et la concurrence importante.

    Dans le privé, les labo font plus souvent appel à la sous traitance (outsourcing) mais contrairement en infomatique les missions sont rares (du fait du piratage des postes par des informaticiens incompétants venant d'ssii) et surtout très courte (1 mois en moyenne).

    Mais le tableau n'est pas si noir si l'on a dans son panel de compétences certains logiciels recherchés mais dont la plupart des masters ignorent car les licences coutent chère. Le meilleur exemple étant SAS.

    bon courage
    desdemone

  4. #3
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    Euh, ce n'est pas vraiment le cas. Beaucoup de boites de biotechnologie recherchent des bioinformaticiens, ainsi que les boites pharmaceutiques, et la plupart des CDD sont pour une durée minimale de 6 mois, sans compter les cdi qui sont proposés.
    La bioinformatique a comme débouché bien sûr la génomique, l'arnomique, la protéique, la modélisation moléculaire, la modélisation de population et encore pas mal de choses, en fait tout ce qui permet d'analyser/prédire des informations biologiques.
    Pour le salaire d'un débutant, cela va habituellement de 1600€ à 2200 € net selon les compétences et le type de boite.
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  5. #4
    GottferDamnt

    Re : bioinformatique

    Salut,

    Je suis également intéressé par la bioinformatique. Y aurait-il un descriptif plus détaillé des débouchés? J'aimerais savoir si de la modélisation physiologique/simulation informatique d'organe rentre dans le rôle du bioinformaticien.

  6. #5
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    Salut,

    Oui tout à fait, tu peux faire de la modélisation physiologique ou de la simulation informatique d'organes. J'avais vu cette société qui semble axée sur ce sujet : http://www.ibiocomputing.com/ .
    Pour une liste de débouchés complète, je n'en ai pas encore trouvé, mais les étudiants de ma filière sont en train d'en faire une pour la mettre sur notre site.
    Ce que tu peux faire, c'est venir sur notre forum et poser des questions dans la partie libre, des professeurs et des étudiants devraient pouvoir te donner pas mal d'exemples de débouchés vu qu'on travaille dans pas mal de domaines.
    J'en profiterai pour démarrer un post ici sur les débouchés en bioinfo.
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Bedbug105

    Re : bioinformatique

    J'en profiterai pour démarrer un post ici sur les débouchés en bioinfo.
    Salut

    Oui super idée, ça permettrait d'apporter un peu d'éclairage pour ceux qui sont intéressés, mais qui ne voient pas très bien où ça peut mener (les comme moi, quoi )

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  10. #7
    zygomatique

    Re : bioinformatique

    ha oui oui!!

    Moi ce que j'aimerais savoir c'est quel type d'activités peut avoir le bio-informatitien concrètement.
    vive l'orhtografe...zut... l'ortographe...mais heu!! L'ORTHOGRAPHE... ha ba enfni...

  11. #8
    GottferDamnt

    Re : bioinformatique

    Citation Envoyé par Erenthil Voir le message
    Salut,

    Oui tout à fait, tu peux faire de la modélisation physiologique ou de la simulation informatique d'organes. J'avais vu cette société qui semble axée sur ce sujet : http://www.ibiocomputing.com/ .
    Pour une liste de débouchés complète, je n'en ai pas encore trouvé, mais les étudiants de ma filière sont en train d'en faire une pour la mettre sur notre site.
    Ce que tu peux faire, c'est venir sur notre forum et poser des questions dans la partie libre, des professeurs et des étudiants devraient pouvoir te donner pas mal d'exemples de débouchés vu qu'on travaille dans pas mal de domaines.
    J'en profiterai pour démarrer un post ici sur les débouchés en bioinfo.
    Merci pour ces liens ! Je suis intéressé par la génétique mais je ne souhaite vraiment pas m'y limiter (et je ne suis pas forcement attiré par la biostat). Mais le lien de la société me rassure un peu .

  12. #9
    derrien56

    Re : bioinformatique

    bonjour,
    je suis interréssée par les biostatistiques. y a -t'il beaucoup de débouchés??
    Quelles études faut-il faire pour devenir biostatisticien?? ( je suis en TS) on m'a conseillé de faire des études de statistiques puis ensuite de me spécialiser en biostats, est-ce bien??

  13. #10
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    Désolé pour la lenteur de la réponse, mais stage+projet à rendre=plus de temps

    Alors Zygomatique, un exemple de bioinformatique (Yoyo, si tu veux me reprendre ou compléter): un biologiste étudie un phénomène biologique et aimerait trouver de nouveaux candidats potentiels pour ce phénomène. Le seul souci, c'est que le faire à la main, ça veut dire regarder/tester au bas mot environ plusieurs milliers de candidats et où la très grande majorité ne sera pas intéressante, provoquant ainsi des coûts en temps et en argent importants. Et là le bioinformaticien arrive, étudie le phénomène et discute avec le biologiste, puis réalise un projet (après avoir ) qui permettra de sortir une dizaine de candidats présentant une forte probabilité pour le phénomène. Le biologiste n'a plus " qu'à tester " ces derniers candidats et à étudier son phénomène.

    Voici aussi un article, présentant un exemple plus concret de bioinformatique : Techno Sciences
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  14. #11
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    derrien56, je ne connais malheureusement que 2 personnes dans ma filière qui était vraiment axée biostatistiques : l'une est actuellement en stage à Nantes et l'autre s'est réorientée cette année dans une filière de stats pures.

    Niveau débouchés, je vois pas mal d'offres d'emplois/postdocs où des connaissances en biostatistiques sont fortement recommandées. Si tu veux voir une partie des offres proposées, tu peux t'inscrire à cette mailing list : http://listes.sfbi.fr/wws/subrequest/bioinfo ou bien regarder les archives ici

    Sinon à Orsay (je ne connais que ce parcours pour les biostatistiques), pour faire des biostats, tu peux faire les 2 premieres années de licence de maths (ça te permet d'avoir un bon bagage en maths), et ensuite intégrer la filière de BioInformatique et BioStatistiques, en choisissant les options de statistiques pour en faire le plus possible.
    J'ai rapidement regardé sur Google pour d'autres formations, et j'ai trouvé ce lien aussi.
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  15. #12
    derrien56

    Re : bioinformatique

    Citation Envoyé par Erenthil Voir le message
    derrien56, je ne connais malheureusement que 2 personnes dans ma filière qui était vraiment axée biostatistiques : l'une est actuellement en stage à Nantes et l'autre s'est réorientée cette année dans une filière de stats pures.

    Niveau débouchés, je vois pas mal d'offres d'emplois/postdocs où des connaissances en biostatistiques sont fortement recommandées. Si tu veux voir une partie des offres proposées, tu peux t'inscrire à cette mailing list : http://listes.sfbi.fr/wws/subrequest/bioinfo ou bien regarder les archives ici

    Sinon à Orsay (je ne connais que ce parcours pour les biostatistiques), pour faire des biostats, tu peux faire les 2 premieres années de licence de maths (ça te permet d'avoir un bon bagage en maths), et ensuite intégrer la filière de BioInformatique et BioStatistiques, en choisissant les options de statistiques pour en faire le plus possible.
    J'ai rapidement regardé sur Google pour d'autres formations, et j'ai trouvé ce lien aussi.


    Mercii beaucoup!!

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  17. #13
    zygomatique

    Re : bioinformatique

    Vi merci pour vos renseignements^^
    vive l'orhtografe...zut... l'ortographe...mais heu!! L'ORTHOGRAPHE... ha ba enfni...

  18. #14
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    De rien
    Si vous avez d'autres questions, n'hésitez pas
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  19. #15
    Naulus

    Re : bioinformatique

    Salut tout le monde.
    Ca fait maintenant pas mal de temps que je me renseigne sur les formations en biostatistiques et à l'issue de ces recherches je me pose toujours quelques questions:

    Pour faire des biostatistiques, faut-il mieux une formation en maths ou en biologie?
    Il me semble que la réponse est maths mais j'ai vu des formations en biostatistiques ne s'adressant qu'à des titulaires de licence de biologie ce qui m'a surpris.

    J'ai l'impression que les biostatistiques et plus généralement les statistiques sont indiscociables de l'informatique, domaine qui me rebute. Faudra-t-il donc que je me résolve à en faire si je veux devenir biostatisticien?

    Merci de vos réponses!

  20. #16
    derrien56

    Re : bioinformatique

    En effet tu as raison, tous les statisticiens utilisent l'informatique! C'est d'ailleurs pendant une grande partie de leur temps de travail qu'ils se trouvent derrière le poste.


    quant-à la formation, je crois qu'il est possible de faire des biostats après une licence de biologie mais je n'en suis pas du tout sûr. Je pense que c'est mieux de faire d'abord une formation de maths/ statistiques et d'ensuite se spécialiser en biostats

  21. #17
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    Pour faire des biostatistiques, faut-il mieux une formation en maths ou en biologie?
    D'après les cours de stats que j'ai suivi, je conseille une formation en maths plutôt.
    Il me semble que la réponse est maths mais j'ai vu des formations en biostatistiques ne s'adressant qu'à des titulaires de licence de biologie ce qui m'a surpris.
    En effet c'est bizarre que des filières de biostats ne soient ouvertes qu'à des bios, la filière de BioInfo et BioStats d'Orsay est ouverte au infos, maths et bios.
    J'ai l'impression que les biostatistiques et plus généralement les statistiques sont indiscociables de l'informatique, domaine qui me rebute. Faudra-t-il donc que je me résolve à en faire si je veux devenir biostatisticien?
    Oui, l'informatique est important dans ce domaine, mais le niveau demandé n'est quand même pas le même que pour un développeur informatique/bioinformatique. Tu peux regarder ce logiciel (très utilisé par les biostatisticiens), pour avoir une idée des compétences demandées en informatique.
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  22. #18
    MiMoiMolette

    Re : bioinformatique

    Salut,

    Pour exemple de l'application des maths (ça reste un exemple), il y a à l'isup un parcours biostatistiques, alors que l'école est purement pour les matheux.
    - Je peux pas, j'ai cours
    - Vous n'êtes pas un peu vieux ?
    - Je suis le prof

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  24. #19
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    Je ne connaissais pas l'ISUP, merci
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  25. #20
    Naulus

    Re : bioinformatique

    Merci de vos réponses quasi instantanées! J'ai été jeter un coup d'euil au logiciel R merci de m'avoir mis ce lien.

    Les formations types ISUP, ISFA, EnSAE me paraissent être une très bonne carte de visite c'est vrai. Cependant, n'étant pas un crack en maths, et bien qu'éprouvant un intéret certain pour la discipline, elles me semblent difficiles d'accès. C'est pourquoi j'ai l'intention d'imaginer un plan B (au cas où j'échouerais aux concours) en imaginant d'autres parcours possibles.

    Cependant je dois avouer que l'idée de me lancer en fac de maths sans trop savoir où je vais aboutir me refroidit un peu...

    C'est dommage qu'il n'y ait pas de voie plus délimitée pour accéder aux métiers dans les statistiques...

  26. #21
    gaucher

    Re : bioinformatique

    Coucou tout le monde !

    Je suis biostatisticien,je suis passé pour ma part par un iut stid (statistiques et traitement informatique des données) et une école d'ingénieur (ISTIL) avec un parcours "mathématiques appliquées et modélisation".

    Il existe plusieurs types de voies pour arriver aux métiers de la biostatistique (de la stat en générale).

    - Privilégier un parcours matheux
    - Privilégier un parcours de spécialité (biologie) et ensuite se former en statistiques

    Tout d’abord se poser la question de savoir quel métier l’on veux exercer (les branches de la statistiques sont nombreuses) et l’axe qui lui correspond : ingénierie / recherche

    Concernant le parcours maths :
    - La voie universitaire pure : licence, master2. Pour la recherche, un master 2 (de recherche) pourra être préparé dans de nombreuses facultés, également dans des ENS. C’est la voie royale pour la recherche.

    - La voie universitaire professionnelles : Master 2 pro, dut stid, licence professionnelles. Comparable en terme de professionnalisation avec les écoles que je cite ensuite.

    - Les écoles : la encore deux types de formations :
    a) les écoles spécialisées : ENSAI (ingénieur, option biostat), ENSAE (pas de biostat c’est de la finance) ne délivre pas de diplôme d’ingé mais super réputée, ISUP (pas de diplôme d’ingé) mais filière biostatistiques de bonne réputation.
    b) les écoles d’ingénieurs permettant un parcours maths/stats (généralement couplé a de l’info) : grandes généralistes (ecp, enpc, X), ensimag, isitv, istil, CUST, polytech nice, polytech lille,insa toulouse…


    Concernant le parcours de spécialité :
    - beaucoup de personnes de mon entourage professionnel sont titulaire de master de biologie. Le traitement des problématiques statistiques est entrevu parfois différemment (d’un point de vue biologique, moins théorique) mais agit en complément des gens qui comme moi apprécient les grosses formules.

    Il faudra de toute façon se former de manière complémentaire en bio ou en stat. A mon sens privilégier en voie initiale ce que l’on aime particulièrement (les maths ? la bio ?). Après avec la volonté les concepts seront assimilés.

    Pour Naulus :
    Tu n’est pas obligé de partir en fac après le bac : je suis parti en dut stid pour éviter la fac et la prépa. Pour ton niveau en maths, le dut est un bon moyen d’apprendre le métier de statisticien sans être envahis de théorie. C’est très appliqué et moins abstrait que les parcours fac ou cpge.

    Les parcours ci-dessus peuvent bien surs être combinés, les passerelles sont nombreuses, et la concurrence est assez faible car les débouchés sont importants.
    Je recommande la lecture du site de la société française de statistique qui n’est malheureusement pas à jour mais qui a le mérite de bien expliquer le métier.
    http://www.sfds.asso.fr/

    A +

  27. #22
    Naulus

    Re : bioinformatique

    Merci pour les infos!
    Sinon, tu travailles pour un laboratoire pharmaceutique non ou quelque chose du genre ?

  28. #23
    gaucher

    Re : bioinformatique

    Je suis sorti de l'école récemment (2006) mais j'ai eu le temps de bosser 6 mois en labo pharmaceutique pour finalement atterir dans une structure académique.

  29. #24
    GottferDamnt

    Re : bioinformatique

    Petite question: Y a-t-il des débouchés au niveau de recherches en thérapie génique?

    Autrement je ne suis pas a priori très intéressé par les stats, mais plutot par coté info (et bio évidemment)... entre Orsay et P7, y a-t-il une différence d'orientation entre les deux formations proposées?

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  31. #25
    gaucher

    Re : bioinformatique

    Pour les débouchés en thérapie génique voici un document qui pourra peut être t'éclairer :
    http://www.senat.fr/rap/o99-020/o99-020.html
    Dernière modification par gaucher ; 03/04/2008 à 14h16.

  32. #26
    Erenthil

    Re : bioinformatique

    Je ne connaissais pas du tout ce rapport , merci
    Informatique : Alliance d'un science inexacte et d'une activité humaine faillible.

  33. #27
    GottferDamnt

    Re : Bioinformatique

    Intéressant mais ça semble daté.

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