Bien le bonjour !
Je me demandais si l'un de vous aurait une suggestion pour l'étude d'un micro-organisme le plus simple possible. J'avais pensé à la traditionnelle E. Coli, mais la vérité est que je recherche une base de donnée de bactérie qui les classerait en foncion de la taille de leur génome... Bref, quelqu'un connait-il des bactéries plus simples que E. Coli ?
Plus simple ?C'est un bien grand mot, sur quel plan ? taille du gènome, autonomie ?
En terme de génome la palme reviens a Mycoplasma genitalium
Quand le serveur de ncbi fonctionnera un peu mieux, tu pourras lui demander de lister les génomes bactériens séquencés.Envoyé par LicenceXP
Les génomes bactériens les plus petits connus sont ceux du genre Mycoplasma. De là à dire que ce sont des organismes plus "simple", je ne suis pas d'accord. Ils sont évolués de sorte à ce que leur génome soit plus compact, et ils ont apparemment su en tirer un avantage sélectif.
Je crois vraiment qu'en terme de génome, là aussi, ce n'est pas la taille qui compte, mais la façon de s'en servir.
salut
pour les plus petits génomes, je crois que nanoarchae equitans bat mycoplasma genitalium. Mais c'est une archae, pas une bactérie.
580 kbs pour Mycoplasma Genitalium
491 kbs pour Nanoarchaeum equitans
J'adore la Genbank, qui a le même âge que moi!
(Generation GenBank)
Candidatus Carsonella ruddii PV : 160kbs, plus d'infos sur:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/en...ToSearch=20002
à jmbowie : Presque un organelle ton bazar là, non ??
(non pas que le mycoplasme ou le nanoarchaeum soit autonome non plus remarque)
Pour essayer de répondre à la question, s'il s'agit d'étudier la séquence génomique, les organismes proposés sont de bons candidats "didactiques". Si l'étude comporte une partie expérimentale humide, mieux vaut se rabattre sur E.Coli non ??
Une alternative a Genbank pour l'état de l'art des organismes séquencés :
http://www.genomesonline.org/
(ne vous fiez pas à l'aspect horrible du design de la page)
Sed
Génération Genbank, pas mal. Génération Tchernobyl aussi, malheureusement.
Sed, en tout cas c'est un endosymbiote (ceci expliquant cela)
à jmbowie : Presque un organelle ton bazar là, non ??
(non pas que le mycoplasme ou le nanoarchaeum soit autonome non plus remarque)
Pour essayer de répondre à la question, s'il s'agit d'étudier la séquence génomique, les organismes proposés sont de bons candidats "didactiques". Si l'étude comporte une partie expérimentale humide, mieux vaut se rabattre sur E.Coli non ??
Une alternative a Genbank pour l'état de l'art des organismes séquencés :
http://www.genomesonline.org/
(ne vous fiez pas à l'aspect horrible du design de la page)
Sed
Génération Genbank
Ton lien est une vraie mine d'or Voici ce que j'ai trouvé, à mettre dans les favoris:
http://www.genomesonline.org/gold.cg...mplete+Genomes
J'ai dit génome le plus simple, en présumant (faussement, je m'en doute bien) que si le génome est simple, l'organisme l'est aussi. Ce que je recherche est en fait un organisme au fonctionnement le plus simplement possible, avec un minimum d'organite, en fait juste ce qu'il faut pour pouvoir se multiplier et rien de plus !
salut
autrement tu peux aller voir du côté des virus. Pour beaucoup y a pas grand chose de "superflu".
Je pense que de l'avis de tous les mycoplasmes repondent tres bien a la definition de ce que tu recherches.
YOyo
