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Régression logistique



  1. #1
    Kiz

    Régression logistique


    ------

    Bonjour,

    j etudie l activite des termites sur un site donne pendant 2 ans. l activite se mesure simplement par l attaque ou non d appats sur le site. je voudrais savoir si cette activite est liee a la temperature de l air ou aux precipitations. en clair, je veux savoir si il y a une correlation entre l activite des termites et la temperature de l air et/ou les precipitations.

    j ai fait pleins de tests statistiques differents en utilisant differents programmes (jump, statview, exelstat), mais j obtiens des reultats differents a chaque fois et finalement je ne suis pas sur de ce que j ai fait.

    voici mes donnees (du moins une partie mais si je comprends comment faire avec celles la, je pourrai le faire avec le reste!)
    http://i201.photobucket.com/albums/a...orrelation.jpg

    je pense que le test a utiliser est une regression logistique, mais je n arrive pas a la faire sur les logiciels que j ai a ma disposition (xlstat, statview, jump, R). faut dire que je suis vraiment pas bon en stat... et je trouve que le logiciel le plus simple est xlstat donc si qqn peut m expliquer comment faire, il serait d un TRES grand secours! si c est un autre logiciel je suis preneur qd meme mais faut vraiment me detailler toutes les etapes car je suis vraiment nul!

    merci pour vos reponses

    -----

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  3. #2
    Alegs

    Re : Regression logistique

    Bonsoir!!
    J'ai quelques bases en statistiques biologiques mais ça vole pas très haut non plus!

    Moi je dirais qu'il faudrait déjà classer tes données dans l'ordre.

    Je m'explique: il faudrait que tu puisses refaire le même tableau mais en présentant tes résultats d'attaque en fonction de la précipitation, en y allant crescendo, idem pour la température. Les résultats paraîtront peut être moins "fouilli" si je puis dire,

    Déjà en regardant ton classement "standard" selon les mois, on voit très vite que les termites, comme beaucoup d'insectes, sont hyperactives en été (en terme de saison), et moi ça me semble très correct. Faudrait faire pareil donc pour les précipitations et température!

    Ensuite tu pourrais envisager de "simplifier", c'est à dire catégoriser, et par exemple définir 3 grandes zones de précipitation (faible, moyen, fort; avec les bornes entre chaque niveau), puis 3 grandes zones de température (froid/"tempéré"/chaud) et puis ça te fait une espèce de tableau à 2 entrées, puis tu essaies de caser les activités en forte, moyenne, faible...


    Cela dit, je me doute bien qu'il va falloir "prouver" ce que tu avances en passant par des tests statistiques, et pour ça je ne serais d'aucune utilité, surtout si on considère les logiciels...
    Bon courage en tout cas!!

  4. #3
    kinette

    Re : Régression logistique

    Bonjour,

    Est-ce que les appâts étaient renouvelés?
    Est-ce que la date a pour toi une importance? (ce qui complique les choses... car on a des séries temporelles).

    A priori je dirais déjà que tu dois entrer température et précipitation comme facteurs et aussi regarder s'il y a une interaction.
    Comme tu as des proportions, oui, a priori c'est une régression binomiale...

    Cordialement,
    K
    Nomina si nescis, perit et cognito rerum.

  5. #4
    Kiz

    Re : Régression logistique

    bonjour a tous
    content de voir que mon probleme interesse quelques personnes! j avais peur de me retrouver seul!

    Alegs,
    j avais pas pense a ca mais oui effectivement ca peut etre une solution je pense si je ne trouve pas d autres possibilites. mais je suis presque sur qu il existe un test statistique fait pour ce genre de questions. en fait il semble a vu d oeil qu il existe une correlation mais figure toi qu avec d autres types d appats, ce n est pas si sur! dans les donnees que j ai montrees, je n ai mis que les donnees qui semblent montrer une correlation. en tout cas merci pour ta reponse. ca fait toujours plaisir de ne pas se sentir seul.

    Kinette,
    les appats sont renouvelles a chaque fois. les dates importent dans la mesure ou j espere montrer qu il y a une correlation avec les saisons. d une certaine maniere, si j arrive a montrer qu il y a une correlation avec la temperature de l air et les precipitations, je montrerai qu il y a une correlation avec les saisons. je ne sais pas si c est une regression binomiale, moi j avais pense a une regression logistique d apres ce que j avais pu lire et d apres l avis de personnes, mais j ai pas reussi a aller plus loin. mais peut etre que regressions binomiale et logistique sont synonymes, je n y connais pas grand chose.

    merci pour ces debuts de reponses

  6. A voir en vidéo sur Futura
  7. #5
    kinette

    Re : Régression logistique

    Bonjour,
    Oui, régression logistique et binomiale c'est synonyme...

    Le problème avec tes données c'est qu'il y a beaucoup de chances que tes trois facteurs (temps/humidité/température) soient corrélés.

    Donc tu vas te retrouver à travailler avec un modèle linéaire généralisé (pas une simple régression logistique).

    Pour le temps: tu peux faire le choix de considérer que le moment de l'année est une variable linéaire... seulement le truc problématique c'est qu'en fait ce n'est pas le cas (cycle...).

    Si on voulait en plus être perfectionniste, l'année devrait être prise en compte (comme facteur aléatoire?).

    Pour ceux que ce genre de problématique intéresse, je viens de tomber sur ce document:
    http://www.invs.sante.fr/publication...df/rapport.pdf
    Il y a notamment des exemples d'étude de composante saisonnière...

    Bref, en y regardant de plus près, si on veut analyser tes données correctement... c'est loin d'être si simple.
    Quel est ton niveau d'études?

    Cordialement,
    K
    Nomina si nescis, perit et cognito rerum.

  8. #6
    Kiz

    Re : Régression logistique

    bonjour

    oulala apparemment mon probleme n est pas simple
    mon niveau d etude est une these en biologie animale, donc les stats ca s arrete a mon deug et j ai plus aucun souvenir (j ai du faire un chi 2 recemment et j ai du retrouver comment faire...)

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  10. #7
    kinette

    Re : Régression logistique

    Bonjour,
    Bon, comme tu es en thèse, tu peux te plonger dans les stats (jamais un mal... et faire un truc "grossier" est bien plus risqué à ce niveau qu'avant).
    J'avoue ne pas être super optimiste pour tes données, car le peu de mesures (je sais ça fait toujours mal quand on sait le boulot que ça peut représenter, ne le prends donc pas mal) ne doit pas permette une très grosse puissance.

    N'étant pas une spécialiste même si j'aime bien ça, je te conseille de passer voir les gens du forum des utilisateurs de R. Il y a des gens autrement plus calés que moi, et généralement de bon conseils (en plus ça te permettra de te familiariser avec ce beau logiciel).

    http://forums.cirad.fr/logiciel-R/index.php

    Bon courage!
    K
    Nomina si nescis, perit et cognito rerum.

  11. #8
    Kiz

    Re : Régression logistique

    Merci Kinette, je vais aller voir ces personnes
    J avais essaye de me mettre a ce logiciel mais trop complique pour moi
    En revanche, xlstat me semblait bcp plus simple d utilisation mais le logiciel m indiquait que je n avais pas assez de data pour le lancer, ce que tu sembles confirmer...
    Mais il est trop tard pour avoir plus de donnees, faut que je fasse avec..
    Merci encore!

    PS
    je suis pas en these, je suis en post doc!

  12. #9
    kinette

    Re : Régression logistique

    Citation Envoyé par Kiz Voir le message
    je suis pas en these, je suis en post doc!
    Oups, désolée
    Bienvenu au club!
    Et bon courage pour tes données.

    K
    Nomina si nescis, perit et cognito rerum.

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