Plasmide et insert

[invite59c4064c]

bijour tous !!

j'ai une petite question new par rapport a un enonce d'un TD que je narrive aps a resoudre:

"Une sequence nucleotidique de l'insert chromosomique present dans un plasmide Pl31 est obtenue et analyse. La taille de l'insert est curieusement petite, 300 nucleotides, ne contient pas de cadre ouvert de lecture et presente un nombre de sites de methylationdes adenine GATC relativement elevee"
voici les questions
1) reconaissez vous la region identifie de l'insert?
2) Pensez vous qu'une analyse supplementaire devrait vous permettre d'identifier d'autres sites dans cette region.

voila pour l'inser moi j'ai pensé a un site Ori (replication ) car bocou de GATC
mais je ne vois pas l' analyse supp ke je pourais faire pour identifier d'autre site

Si quelqu'un pourrait m'aider!!! merci
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[MaliciaR]

Hello,

Oui, il s'agit d'une ORI. Celle de coli par exemple fait 245 pb.

Pour l'analyse supplémentaire, réfléchis : si tu as affaire à une ORI, c'est que généralement tu vas avoir une région AT-rich qui facilitera l'ouverture du double-btrin; puis, tu es bien d'accord que si c"est une ORI, tu dois bien avoir des sites de fixation de la DnaA. Enfin, tu as aussi des sites IHF-FIS- binding (je ne sais pas si l'on vous en a parlé en cours...).


Cordialement,

[invite59c4064c]

oui je connait IHF et FIS ce sont des sequence specifique sur DNA A (histone non?) mais leur exact c quoi ??
ET je ne vois pas exactement l'experience kon peut realiser pour voir d'autres sitesdans cette region
please si tu peux me dire!!!

[invite59c4064c]

mais quel est leur lien avec les sites a hautes affinite sur DnaA.
Quel est le role de ces histone like protene? merci

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite59c4064c]

que represente exactement IHF et FIS dans la replication?

[jmbowie]

que represente exactement IHF et FIS dans la replication?

Aucune à ce que je sais: il s'agit de facteur généraux de transcription qui agissent sur la topologie locale de l'ADN et régulent la transcription de nombreux gènes. Peut-être qu'ils ont aussi un effet dans la réplication, mais je ne pense pas que ce soit le propos ici.