Acide Aminé

[invitebc311044]

bonjour,
je suis entrain de lire un article et j'ai dû mal avec quelques termes :
amino acid offset et amino acid overlaps

Le probleme est que je n'arrive pas à trouver d'équivalent français !!

si quelqu'un pouvait m'aider, je serai sympa
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[Zellus]

Bonjour,

Tu n'aurais pas le passage de ton article dans lequel il y a ces termes ? Parce que juste comme ça c'est pas évident de savoir de quoi tu parles. Sinon overlap = chevauchement et offset = compensation. Si ça peut t'aider ...

[invitebc311044]

Bonjour,

Tu n'aurais pas le passage de ton article dans lequel il y a ces termes ? Parce que juste comme ça c'est pas évident de savoir de quoi tu parles. Sinon overlap = chevauchement et offset = compensation. Si ça peut t'aider ...

merci, mais enfaite je ne vois ce qu'est un acide aminé de compensation !!!

voici le passage : Once the IgE binding regions were
identified the peptides were synthesized with one amino
acid offset and nine amino acids overlap to define the specific
epitope.

merci d'avance

[Zellus]

Ah ouiiii !!! Pourtant en immuno j'en avais plein à lire des articles sur la recherche d'épitope !
En fait je suppose qu'ils recherchent l'épitope d'une protéine reconnu par ton IgE. Donc ils synthétisent des peptides de 10 acides aminés ici (c'est bien ça ?) qui recouvrent toute la séquence de ta protéine (ou plutôt ici une région de ta protéine vu que ça semble être une étape d'affinage non ?). Et deux peptides qui se suivent se chevauchent vu qu'ils partagent 9 acides aminés en commun ("nine amino acids overlap"), et on passe d'un peptide au suivant en décalant la séquence d'un acide aminé ("one amino acid offset").

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitebc311044]

Merci pour tes réponses, j'ai un peu mieux compris !!!

parc ontre est-ce que tu connais la technique auto-spot ou la technique spot ???

merci

[Zellus]

C'est juste une technique de synthèse de tes peptides en phase solide. C'est à dire qu'ils sont synthétisés acide aminé par acide aminé avec des cycles de protection/déprotection directement sur une membrane de cellulose. Et tout ça est automatisé comme tu peux le voir ici, ce qui permet de tester plein de peptides en même temps.