[Divers] Bioinformatique
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Bioinformatique



  1. #1
    invite552753b4

    Bioinformatique


    ------

    j'aurais bien aimé savoir ce que c'est une multi-FASTA format pour une séquence?
    merci

    -----

  2. #2
    invitee863e61a

    Re : Bioinformatique

    Citation Envoyé par futurette Voir le message
    j'aurais bien aimé savoir ce que c'est une multi-FASTA format pour une séquence?
    merci
    L'écriture "FASTA" est un façon un peu codée d'écrire une séquence:

    >nomdelaséquence
    CTGACATACTATCCTA

    Il faut respecter le symbole ">" et le saut de ligne

    Le format multi-fasta permet d'indiquer à un logiciel la présence de plusieurs séquence à la suite:

    >nomdelaséquence
    CTGACATACTATCCTA
    >nomdelaséquence2
    CTGACATACTATCGCA
    >nomdelaséquence3
    CTGACATACTATCGACA

    En rentrant les séquences ainsi, un logiciel (par exemple d'alignement de séquences) pourra distinguer les différentes séquences et les aligner.
    Bon courage

  3. #3
    invite7c16fbbe

    Re : Bioinformatique

    Le terme multi-FASTA n'est pas très employé, puisque vu la simplicité du format la majorité des logiciels sont multi-FASTA.

  4. #4
    invite552753b4

    Re : Bioinformatique

    merci bcp! justement je voudrais aligner plusieurs séquences... et analyser des séquences...

  5. A voir en vidéo sur Futura

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