génétique - endonucléases de restriction

[invitea7e31817]

Bonjour,

j'ai un exercice à résoudre et je ne vois pas du tout (mais vraiment pas du tout!!) comment procéder...

"Un ADN génomique contenant 40% de guanine est hydrolysé par une enzyme de restriction reconnaissant le palindrome AATT. Quelle est la taille moyenne des fragments générés par l'hydrolyse enzymatique?"

Je sais que certaines enzymes coupent à l'intérieur du palindrome, d'autres à 20 paires de base du palindrome, et d'autres encore à 1000-5000 pb du palindrome... Mais de laquelle il s'agit ici ?

L'ADN contient 40% de guanine, j'en conclu qu'il y a 40% de cytosine, et 10 % de thymine et adénosine...

Et voilà où j'en suis de ma réflexion... c'est à dire pas très avancée...

Toute aide est la bien venue, alors si quelqu'un qui passe par là y comprend quelque chose...

Merci!
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[piwi]

Bonjour.
Vous avez compris la principe de l'exercice. En général, en première approximation, on considère la distribution des nucléotides comme aléatoire. On a donc à chaque position une chance sur quatre de trouver chacun des nucléotides.
Donc la probabilité de trouver un site est (1/4)ⁿ avec n la taille du site de restriction. Ce genre de calcul vous amène à conclure qu'une enzyme telle que EcoRI génère des fragments de 4096 pb en moyenne.

Mais vous n'avez pas fait l'hypothèse d'équiprobabilité et vous n'utilisez pas EcoRI
Cependant avez vous une idée à présent?

Cordialement,
piwi

[invitea7e31817]

Merci!

Si j'ai bien compris, il me suffit de calculer:
(1/10)^-4=10 000
et le tour est joué?!

[piwi]

J'en ai bien peur

Cordialement,
piwi

[A voir en vidéo sur Futura]