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Séquençage d'un peptide




  1. #1
    mlkgiosn

    Séquençage d'un peptide

    Je voudrais savoir ce que donnerait ce peptide :

    Ala-His-Val-Lys-Pro-Arg-Val-Leu-Ile

    après un traitement par la trypsine.


    Il me semble qu'il devrait donner ça :

    Ala-His-Val-Lys-Pro-Arg et Val-Leu-Ile., mais j'aimerais avoir votre avis.

    -----


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  3. #2
    VilCrocrotte

    Re : Séquençage d'un peptide

    Bah, la trypsine agit après une arginine, donc ce que tu as mis est correct ;-D
    VilCrocrotte !! Le super Génie !!

  4. #3
    mlkgiosn

    Re : Séquençage d'un peptide

    Citation Envoyé par VilCrocrotte Voir le message
    Bah, la trypsine agit après une arginine, donc ce que tu as mis est correct ;-D
    Oui, et normalement après la lysine aussi, mais là, il y avait Lys-Pro, donc c'est surtout ça que je voulais savoir, mais je ne me suis pas trompé, cette liaison n'est pas coupée par la trypsine.


  5. #4
    Katie20012

    Re : Séquençage d'un peptide

    Bah oui c'est tout à fait logique
    "On se lasse de tout,excepté d'apprendre."-Virgile.

  6. #5
    VilCrocrotte

    Re : Séquençage d'un peptide

    Oui mince, j'ai oublié la lysine aussi ))
    Donc lys et arg

    Mais pourquoi poser la question alors? ^^
    VilCrocrotte !! Le super Génie !!

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    mlkgiosn

    Re : Séquençage d'un peptide

    Citation Envoyé par VilCrocrotte Voir le message
    Oui mince, j'ai oublié la lysine aussi ))
    Donc lys et arg

    Mais pourquoi poser la question alors? ^^
    Non, justement, pas Lys, puisqu'il y a Pro après.

    Quant à la question, ben c'est juste pour avoir une confirmation parce que je n'étais pas sûr de moi.

    Donc je récapitule, la trypsine ne coupe pas après Lys, "à cause" de Pro, mais elle coupe après Arg, c'est ça ?

  9. #7
    Katie20012

    Re : Séquençage d'un peptide

    Oui c'est exactement ça, la trypsine ne coupe pas après Lys dans ce cas parce qu'elle est suivie de la proline, mais elle coupe après Arg.
    Cordialement,
    Katie.
    "On se lasse de tout,excepté d'apprendre."-Virgile.

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  11. #8
    mlkgiosn

    Re : Séquençage d'un peptide

    Citation Envoyé par Katie20012 Voir le message
    Oui c'est exactement ça, la trypsine ne coupe pas après Lys dans ce cas parce qu'elle est suivie de la proline, mais elle coupe après Arg.
    Cordialement,
    Katie.
    OK, merci, maintenant, je sais que j'ai compris.

  12. #9
    VilCrocrotte

    Re : Séquençage d'un peptide

    Je ne comprend pas pourquoi elle ne couperai pas à cause d'une proline?
    VilCrocrotte !! Le super Génie !!

  13. #10
    mlkgiosn

    Re : Séquençage d'un peptide

    Citation Envoyé par VilCrocrotte Voir le message
    Je ne comprend pas pourquoi elle ne couperai pas à cause d'une proline?
    Tout simplement parce que la trypsine coupe en C-terminal des acides aminés Lysine et Arginine, sauf si la proline et à droite de ces deux-là, mais ne me demande pas pourquoi.

  14. #11
    VilCrocrotte

    Re : Séquençage d'un peptide

    Peut être dù à la structure de la proline qui constitue un demi cycle où il gène l'enzyme dans son mode d'action peut être =D
    VilCrocrotte !! Le super Génie !!

  15. #12
    mlkgiosn

    Re : Séquençage d'un peptide

    Citation Envoyé par VilCrocrotte Voir le message
    Peut être dù à la structure de la proline qui constitue un demi cycle où il gène l'enzyme dans son mode d'action peut être =D
    C'est aussi ce que je me suis dit, faut pas chercher, la proline, elle est là juste pour emmer***, LOL.

    Non, mais je pense que c'est ça, vu qu'elle a une structure différente des autres acides aminés.

  16. #13
    Katie20012

    Re : Séquençage d'un peptide

    Hello;
    C'est surement due à ça structure particulière, car la proline est le seul acide aminé dont la fonction amine soit secondaire, et possède un noyau pyrrole (4 carbones et 1 azote).
    Cordialement,
    Katie.
    "On se lasse de tout,excepté d'apprendre."-Virgile.

  17. #14
    mlkgiosn

    Re : Séquençage d'un peptide

    Citation Envoyé par Katie20012 Voir le message
    Hello;
    C'est surement due à ça structure particulière, car la proline est le seul acide aminé dont la fonction amine soit secondaire, et possède un noyau pyrrole (4 carbones et 1 azote).
    Cordialement,
    Katie.
    Oui, et à part ça, et en plus je ne vois pas quels autres raison il y auraient, donc c'est très probablement ça.

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