Séquençage d'un peptide

[mlkgiosn]

Je voudrais savoir ce que donnerait ce peptide :

Ala-His-Val-Lys-Pro-Arg-Val-Leu-Ile

après un traitement par la trypsine.


Il me semble qu'il devrait donner ça :

Ala-His-Val-Lys-Pro-Arg et Val-Leu-Ile., mais j'aimerais avoir votre avis.
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[VilCrocrotte]

Bah, la trypsine agit après une arginine, donc ce que tu as mis est correct ;-D

[mlkgiosn]

Bah, la trypsine agit après une arginine, donc ce que tu as mis est correct ;-D

Oui, et normalement après la lysine aussi, mais là, il y avait Lys-Pro, donc c'est surtout ça que je voulais savoir, mais je ne me suis pas trompé, cette liaison n'est pas coupée par la trypsine.

[Katie20012]

Bah oui c'est tout à fait logique

[VilCrocrotte]

Oui mince, j'ai oublié la lysine aussi ))
Donc lys et arg

Mais pourquoi poser la question alors? ^^

[A voir en vidéo sur Futura]

[mlkgiosn]

Oui mince, j'ai oublié la lysine aussi ))
Donc lys et arg

Mais pourquoi poser la question alors? ^^

Non, justement, pas Lys, puisqu'il y a Pro après.

Quant à la question, ben c'est juste pour avoir une confirmation parce que je n'étais pas sûr de moi.

Donc je récapitule, la trypsine ne coupe pas après Lys, "à cause" de Pro, mais elle coupe après Arg, c'est ça ?

[Katie20012]

Oui c'est exactement ça, la trypsine ne coupe pas après Lys dans ce cas parce qu'elle est suivie de la proline, mais elle coupe après Arg.
Cordialement,
Katie.

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[mlkgiosn]

Oui c'est exactement ça, la trypsine ne coupe pas après Lys dans ce cas parce qu'elle est suivie de la proline, mais elle coupe après Arg.
Cordialement,
Katie.

OK, merci, maintenant, je sais que j'ai compris.

[VilCrocrotte]

Je ne comprend pas pourquoi elle ne couperai pas à cause d'une proline?

[mlkgiosn]

Je ne comprend pas pourquoi elle ne couperai pas à cause d'une proline?

Tout simplement parce que la trypsine coupe en C-terminal des acides aminés Lysine et Arginine, sauf si la proline et à droite de ces deux-là, mais ne me demande pas pourquoi.

[VilCrocrotte]

Peut être dù à la structure de la proline qui constitue un demi cycle où il gène l'enzyme dans son mode d'action peut être =D

[mlkgiosn]

Peut être dù à la structure de la proline qui constitue un demi cycle où il gène l'enzyme dans son mode d'action peut être =D

C'est aussi ce que je me suis dit, faut pas chercher, la proline, elle est là juste pour emmer***, LOL.

Non, mais je pense que c'est ça, vu qu'elle a une structure différente des autres acides aminés.

[Katie20012]

Hello;
C'est surement due à ça structure particulière, car la proline est le seul acide aminé dont la fonction amine soit secondaire, et possède un noyau pyrrole (4 carbones et 1 azote).
Cordialement,
Katie.

[mlkgiosn]

Hello;
C'est surement due à ça structure particulière, car la proline est le seul acide aminé dont la fonction amine soit secondaire, et possède un noyau pyrrole (4 carbones et 1 azote).
Cordialement,
Katie.

Oui, et à part ça, et en plus je ne vois pas quels autres raison il y auraient, donc c'est très probablement ça.