Calculer la taille d'un fragment dans une carte de restriction

[invitede613ffb]

Bonjour,

je suis étudiante en chimie mais j'ai pris l'option bio au second semestre.

Dans un exercice, on nous demande de calculer la taille des fragments d'adn produit de la digestion en utilisant les fragment d'adn marqueurs de taille.
On a donc deux puit : 1 avec les fragments à calculer
1 avec des fragments dont on connait la taille et la distance de migration.

A partir de ces donnée, quelle démarche je dois suivre pour pouvoir calculer la taille des premiers fragments .

Merci d'avance pour réponse.
-----

[invitede613ffb]

sujet de l'exercice :

http://perso.univ-rennes1.fr/stephan.../td_5_et_6.htm

exercice 2, question 3.4

[invite853321bf]

Oh, une Rennaise!!! Kenavo. Normalement, les fragments migrent en fonction de leur taille, il va donc y avoir une relation entre... si tu trouves entre quoi et quoi, tu auras ta solution

[invitede613ffb]

bonjour,

il y a une relation entre la distance parcourue et la taille.
mais je ne connais pas cette relation (et je ne la trouve pas dans mon cours).

Si quelqu'un pouvait me la donner pour que je puisse faire les calculs, ce serait gentil.

Les partiels sont dans 1 semaine et c'est une question récurente.

Le reste des exercices ne pose pas (ou peu) de problème.

merci
kenavo

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite853321bf]

Pardon je n'avais pas regardé l'énoncé avant.
Cette relation n'est pas fixe car elle va dépendre de tes conditions de migrations, qui sont fixés par le voltage appliqué, ainsi que l'intensité dudit courant, et la concentration de ton gel. Donc on la calcule à chaque fois.
Mais là je ne me servirais même pas de ça. Tu as un plasmide rond dont tu connais la taille, un insert dont tu peux connaitre la taille d'après le puits 1, et tu peux découvrir la position des sites claI et PstI dans cet insert par les 2 et 3.
Donc tu peux reconstruire le schéma figure 2 en rajoutant l'insert et ces sites de restriction.
Après tu n'auras plus qu'à faire des soustractions

[Flyingbike]

D'apres l'énoncé il faut se baser sur la migration si j'ai bien suivi. Pour ça ill faut utiliser la relation décrite ici (tout en bas)

[invitede613ffb]

merci,

il faut donc que je trace la droite log(M) = f(d) avec les marqueurs de taille.
Et ensuite que je l'utilise pour déterminer la taille des fragments.

merci beaucoup pour votre aide.

[invite853321bf]

en fait non, la taille des fragments est déjà indiqué sur la figure 3. Là en fait, la difficulté de l'exercice est de coupler l'info de la restriction de ton plasmide et insert par l'un puis par l'autre, et de "deviner" ce qu'il va se passer une fois que je ferai les deux en même temps.
Dans ce cas, je reconstuirai le plasmide avec l'insert en indiquant les endroits possibles pour les différents sites de coupure. Ainsi tu pourras connaitre avec précision la coupure avec les deux.
Du puits 2, tu vois que t'as deux sites de coupure ClaI dans ton plasmide + insert. Hors le plasmide seul n'en a qu'un. Conclusion, ton insert a aussi un site de coupure ClaI. Tu peux donc donner une position possible à ce site dans ton insert. Tu fais pareil avec PstI et ainsi tu pourras savoir la taille des différents fragments.

[invitead7b5233]

Bonjour à tous
J'ai eu le meme exercice à faire, et voici le corrigé :
Le problème est que je ne comprends pas les sites de restriction , par exemple pourquoi ClaI n'est pas à 422? et pstI à 771?
Merci d'avance