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Lecture sequence ADN et codon initiateur



  1. #1
    manol26

    Lecture sequence ADN et codon initiateur

    Bonjour tout le monde je fais appel a vos connaissances concernant les sequences d'ADN
    Le codon initiateur ATG dans une sequence d'ADN doit-il respecter la "règle de 3" tels que:
    ex: ACA TCA TG et ACA TCA ATG
    si le debut du premier exon correspond au "A" de ACA les deux codons ATG vont-il être pris en compte comme début de la traduction ou juste le deuxième ?
    En gros est-ce que le 1er ATG rencontré après debut de la transcription est utilisé comme codon initiateur de la traduction quelquesoit sont emplacement? Cela vaut-il pour le codon stop egalement?

    J'espère que vous m'avez compris, c'est juste un problème de lecture de séquence en définitive!

    Merci de votre aide

    -----


  2. #2
    piwi

    Re : Lecture sequence ADN et codon initiateur

    Je pense avoir compris
    Le codon initiateur et le codon stop doivent bien être en phase avec le cadre de lecture. C'est à dire qu'il ne suffit pas de lire la séquence brut et de rechercher un ATG ou un STOP, il faut aussi connaitre le cadre de lecture.

    En revanche, l'inverse peut être exploité. Si vous savez que votre protéine débute ou se termine dans une région précise. Si vous ne voyez qu'un ATG ou un STOP là dedans alors il y a fort à parier que ce soit les codons pertinants et vous avez votre cadre de lecture.

    CCTAGCATGAAGCT --> CCTAGCATGAAGCT --> CCTAGC ATG AAG CT

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  3. #3
    manol26

    Re : Lecture sequence ADN et codon initiateur

    Merci bien piwi =)

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