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site de restriction HinfI



  1. #1
    épigénétique

    site de restriction HinfI


    ------

    Bonjour,
    Dans le but de faire une digestion avec HinfI, je trouve toujours des fragments de tailles différentes de celles trouvées dans la littérature.

    Ma séquence est la suivante : 5' TGAAGGAGAAGGTGTCT
    GCGGG
    AGTCGATTTCATCATCACGCAGCTTTTCTTT GAGGCTGACACATTCTTCCGCTTTGTGAAG GCAT
    GCACCGACATGGGCATCACTTGCCCCATCG TCCCCGGGATCTTTCCCATCCAGGTGAGGG GCCCAGGAGA
    GCCCATAAGCTCCCTCCACCCCACTCTCACCGCACCGTCCT 3'

    Les amorces sont colorées en rouge.

    Le site de restriction de l'enzyme :
    5' ...G ANTC... 3'

    3'....CTNA G...5'

    D'apres mes recherches( Le résultat trouvé selon le site de restriction mapping : http://www.restrictionmapper.org/cgi-bin/sitefind3.pl), la digestion donne 2 fragments de 176 et 22, par contre dans tous les articles ils trouvent deux fragments de 175 et 23, soit un décalage d'une base.

    Pouvez vous m'expliquez cette différence ?c 'est tres urgent .
    Et merci d'avance pour votre aide

    -----

  2. #2
    Flyingbike

    Re : site de restriction HinfI

    je trouve aussi une coupure a 22. Mais en même temps il y a un overhang de 3 bases, ça explique peut etre la différence. C'est si important ?

  3. #3
    mimita20

    Re : site de restriction HinfI

    oui moi aussi je trouve deux fragments 22 et 176, Flyingbike c'est quoi un overhang ? et comment ça explique cette différence ??
    Je me fie quasi jamais aux premières pensées qui me viennent....

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