site de restriction HinfI

[invitea5dfba34]

Bonjour,
Dans le but de faire une digestion avec HinfI, je trouve toujours des fragments de tailles différentes de celles trouvées dans la littérature.

Ma séquence est la suivante : 5' TGAAGGAGAAGGTGTCT
GCGGGAGTCGATTTCATCATCACGCAGCTTTTCTTT GAGGCTGACACATTCTTCCGCTTTGTGAAG GCAT
GCACCGACATGGGCATCACTTGCCCCATCG TCCCCGGGATCTTTCCCATCCAGGTGAGGG GCCCAGGAGA
GCCCATAAGCTCCCTCCACCCCACTCTCACCGCACCGTCCT 3'

Les amorces sont colorées en rouge.

Le site de restriction de l'enzyme :
5' ...G ANTC... 3'

3'....CTNA G...5'

D'apres mes recherches( Le résultat trouvé selon le site de restriction mapping : http://www.restrictionmapper.org/cgi-bin/sitefind3.pl), la digestion donne 2 fragments de 176 et 22, par contre dans tous les articles ils trouvent deux fragments de 175 et 23, soit un décalage d'une base.

Pouvez vous m'expliquez cette différence ?c 'est tres urgent .
Et merci d'avance pour votre aide
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[Flyingbike]

je trouve aussi une coupure a 22. Mais en même temps il y a un overhang de 3 bases, ça explique peut etre la différence. C'est si important ?

[mimita20]

oui moi aussi je trouve deux fragments 22 et 176, Flyingbike c'est quoi un overhang ? et comment ça explique cette différence ??